隨著多種組學(xué)研究技術(shù)的不斷發(fā)展,APExBIO向全球范圍內(nèi)的科研院所、醫(yī)療機構(gòu)等單位提供基于質(zhì)譜分析的蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)服務(wù);基于高通量測序的各種組學(xué)服務(wù);基于計算機輔助藥物設(shè)計服務(wù);以及各種生物信息學(xué)分析服務(wù)。
艾美捷APExBIO多組學(xué)服務(wù)解決方案:
1、基因組重測序
基因組重測序是通過高通量測序?qū)σ延袇⒖蓟蚪M物種的基因組核酸序列進行測定的技術(shù), 通過重測序可以分析個體或群體的遺傳差異性、群體進化等。具體策略方面,可以對全基因組序列進行測序, 即全基因組重測序;也可以只捕獲外顯子區(qū)域進行測序,即外顯子組測序。
2、ATAC-seq
ATAC-seq研究染色質(zhì)可及性,測定特定時空下基因組中所有處于開放狀態(tài)的序列,分析調(diào)控元件, 揭示轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點以及核小體位置,從而研究精細化基因表達的調(diào)控DNA印記等。 該方法細胞用量低至50000個,組織50mg。其信噪比與靈敏性優(yōu)于其他染色質(zhì)可及性研究方法, 可以在全基因組范圍內(nèi)檢測染色質(zhì)的開放狀態(tài)。
3、KAS-seq
研究單鏈DNA相關(guān)生物活性,如正在進行轉(zhuǎn)錄活動或參與調(diào)控轉(zhuǎn)錄活動的單鏈DNA, 可快速準 確地分析轉(zhuǎn)錄活性和增強子活性。該方法可測的多種生物學(xué)活性類型的單鏈,如轉(zhuǎn)錄,增強子等。 該方法細胞用量低至100000個,可測得多類型數(shù)據(jù),對比相應(yīng)ChIP-seq,ATAC數(shù)據(jù)或數(shù)據(jù)庫, 可以得到有單鏈生物學(xué)活性的多類型測序數(shù)據(jù),靈敏度高。
4、RIP-seq
RNA免疫共沉淀測序技術(shù),在體內(nèi)環(huán)境中研究蛋白質(zhì)與RNA相互作用的經(jīng)典實驗方法, 該方法結(jié)合了 RNA 免疫沉淀和高通量測序,其中相互作用的 RNA 通過目標蛋白的免疫沉淀被捕獲。 對捕獲的 RNA 進行高通量測序有助于了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程。應(yīng)用于RNA結(jié)合蛋白(RBPs), mRNA形成核糖核蛋白(RNPs)復(fù)合物, RNA modification等研究。
5、簡化甲基化測序
簡化甲基化測序(Reduced Representation Bisulfite Sequencing,RRBS),是利用限制性內(nèi)切酶對 基因組進行酶切,以富集CpG島以及啟動子等區(qū)域,并經(jīng)Bisulfite處理后,進行單堿基分辨率的甲基化測序技術(shù)。 因其可顯著提高CpG區(qū)域的測序深度,在啟動子區(qū)域、CpG島和增強子元件區(qū)域可以獲得高精度的分辨率,在臨床樣本 的大規(guī)模研究中具有廣泛應(yīng)用。
6、全轉(zhuǎn)錄組
全轉(zhuǎn)錄組測序是特定物種、組織或細胞在特定狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物集合,包括mRNA和非編碼RNA。 目前全轉(zhuǎn)錄組測序主要檢測了mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA。通過聯(lián)合分析,解析RNA間的相互作用及共表達 調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并且進行競爭性內(nèi)源RNA(ceRNA)分析,從而更加全面解析特定的生物學(xué)過程
7、10X Genomics /GEXSCOPE/ SeekOne單細胞RNA-Seq
單細胞轉(zhuǎn)錄組測序(Single cell RNA sequencing)是在單個細胞水平對mRNA進行高通量測序的一項新技術(shù), 針對單個細胞研究其整體水平的基因表達情況,成功解決細胞分子機制研究中常見的細胞異質(zhì)性、 細胞量少而無法進行常規(guī)高通量測序等難題。單細胞測序技術(shù)具有檢測細胞之間異質(zhì)性的優(yōu)勢, 并且能夠識別數(shù)量很少的細胞群。
8、全蛋白組
通過新的質(zhì)譜技術(shù)Data independent acquisition (DIA,數(shù)據(jù)非依賴性采集),我們對樣本中的全部蛋白 質(zhì)進行所有碎片離子的全景式掃描,得到高準確性,少缺失值的蛋白鑒定及相對定量結(jié)果,為生物標志物的發(fā)現(xiàn), 疾病精準分型,生理病理分析,溯源致病基因等研究提供有力支持。
9、Olink蛋白
Olink基于磚利的鄰位延伸分析技術(shù)PEA( proximity extension assay),借助蛋白特異性原理, 核苷酸序列探針及高通量測序平臺,實現(xiàn)對特定疾病相關(guān)蛋白的精確定量。因其極少的樣本需求量, 適應(yīng)各類疾病的多種panel,精確的蛋白定量結(jié)果受到廣泛應(yīng)用,聚焦人類疾病靶點蛋白,為臨床大隊列篩選、 生物標志物的復(fù)核等研究提供有力數(shù)據(jù)支撐。
10、非靶代謝/非靶脂質(zhì)代謝
代謝組學(xué)是研究生命體對外界刺激、病理生理變化以及本身基因突變而引起的分子質(zhì)量小于 1500Da 以內(nèi)的內(nèi)源性代謝產(chǎn)物種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的組學(xué),有助于生物標志物的篩選,研究代謝通路,發(fā)現(xiàn)調(diào)節(jié)酶, 揭示生命活動機制等研究。在疾病診斷、藥靶篩選、營養(yǎng)與健康管理、個性化藥物治療等領(lǐng)域廣泛使用。
11、微生物組
微生物組學(xué)以動植物體或環(huán)境中的所有微生物為研究對象,通過對微生物基因組進行高通量測序, 以獲得樣本中微生物群落結(jié)構(gòu)、進化關(guān)系以及特定環(huán)境的微生物基因功能等。 該技術(shù)突破了傳統(tǒng)微生物不可培養(yǎng)的缺點,在疾病治療、動物健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)發(fā)展等領(lǐng)域廣泛使用。
12、計算機輔助藥物設(shè)計
借助于APExBIO多年的實驗平臺,寶貴的實驗經(jīng)驗與海量數(shù)據(jù)可以更好地為計算機輔助藥物設(shè)計提供驗證。 新興的人工智能技術(shù)與成熟的模擬計算可以更好地指導(dǎo)實驗的進行,打破單向干濕結(jié)合的壁壘, 實現(xiàn)實驗與計算的相互融合。隨著APExBIO與工業(yè)界的積極合作,從收集到的工藝數(shù)據(jù)中探索出一套優(yōu)化底層研發(fā)的方式, 并提供小分子藥物設(shè)計服務(wù)、抗體藥物設(shè)計服務(wù)以及疫苗設(shè)計服務(wù)。
艾美捷科技是APExBIO的中國代理商,為科研工作者提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品與服務(wù)。
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