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PCR反應(yīng)過程中的循環(huán)參數(shù)了解一下

來源:上海佰利萊生物科技有限公司   2024年06月27日 16:03  

循環(huán)次數(shù) :一般為25 a~ 30次。循環(huán)數(shù)決定PCR擴(kuò)增的產(chǎn)量。模板初始濃度低,可增加循環(huán)數(shù)以便達(dá)到有效的 擴(kuò)增量。但循環(huán)數(shù)并不是可以無限增加的。一般循環(huán)數(shù)為30個左右,循環(huán)數(shù)超過30個以后,DNA聚合酶活性逐漸達(dá)到飽和,產(chǎn)物的量不再隨循環(huán)數(shù)的增加而增加,出現(xiàn)了所謂的“平臺期"。


循環(huán)參數(shù)如下:


1.預(yù)變性

模板DNA*變性與PCR酶的*激活對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時間為兩分鐘。

2.變性步驟

循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列*變性,可能的情況下可縮短該步驟時間。變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不*,易造成擴(kuò)增失敗。

3.引物退火

退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴(kuò)增的長度適當(dāng)下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上做出預(yù)估。退火溫度對PCR的特異性有較大影響。

4.引物延伸

引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶最適溫度)。但在擴(kuò)增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略延伸時間隨擴(kuò)增片段長短而定,一般推薦在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設(shè)定為1min/kbp。

5.循環(huán)數(shù)

大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。

6.最后延伸

在最后一個循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持10-30分鐘.使引物延伸*,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。


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