糞生真菌（coprophilous fungi）和瘤胃真菌（rumen fungi）是非常重要也非常特別的一類微生物資源，糞生真菌和瘤胃真菌有密切的相關性，糞生瘤胃真菌是能夠從動物糞便分離到的瘤胃真菌，此類真菌的孢子有一些特殊的機構或機能，如子囊壁較厚，或只有通過動物的消化道高溫作用才能萌發(fā)等特性。反芻動物的瘤胃是細菌、纖毛蟲、真菌良好的培養(yǎng)系統(tǒng)，相對于細菌和纖毛蟲，人們對這一生態(tài)系統(tǒng)中的真菌了解較少，近幾年的研究發(fā)現(xiàn)，瘤胃真菌對飼料中植物結構性物質的降解起主導作用。反芻動物的糞生瘤胃真菌的分布、類群存在極大的多樣性，研究其的多樣性與健康水平的關系，對分析、對評價反芻動物的健康狀況有重要意義。

　　研究概況

　　早在1685年，Leeuwenhoek從青蛙的糞便中分離描述了3個種，1843年，Gruby和Delafond從動物的瘤胃中分離、描述了4個種，從馬的盲腸中分離描述了7個種，Cain于1934年從牛糞中分離到了Zygospermum setosum，從兔糞中分離到了Copromyces bisporus。Roland從兔子、羊、鹿、馬（矮種馬）、鼠、牛、青蛙等動物中分離出了79種糞生真菌（Roland,1998）。Richardson研究了糞生真菌在不同動物類型的、不同緯度范圍、不同季節(jié)糞便中的糞生真菌的種群、數(shù)量多樣性（Richardson，2001）。Giuseppe研究了糞生真菌與瘤胃動物或非瘤胃動物、當?shù)刂脖环植紶顩r和動物采食狀況相關性（Giuseppe, 1998）。Eliasson 等研究了糞生子囊菌的區(qū)域分布，建議劃分成溫帶群和熱帶、亞熱帶群（Eliasson & Lundqvist,1979；Lundqvist (1972)）。特定的氣候帶上分離到的糞生真菌種類不同，從委內(nèi)瑞拉(Jeng and Krug, 1976, 1977)、印度（Subramanian and Lodha, 1968）和熱帶地區(qū)(Cain and Farrow, 1956)分離了一些特殊限定種屬。

　　Orpin發(fā)現(xiàn)專性厭氧真菌存在于相當范圍的草食性動物糞便中（Orpin 1975），在長期的進化中，草食性動物糞便干燥的無氧環(huán)境使得真菌產(chǎn)生耐氧存活結構(Davies 1993)。從動物的糞便中能分離到瘤胃真菌，Milne等有多人已從羊的唾液、糞便中分離到了厭氧瘤胃真菌(Milne, 1989; Lowe, 1987)。國內(nèi)，方心芳1941年從豬糞中分離了Pilobolus sphaerospores和Mucor mucedo，1942分離了P. crystallinus 和M.flavus ,陳慶濤、鄭儒永、張中義、莊文穎等都曾從不同地區(qū)的動物糞便中分離毛霉、枝孢菌、盤菌等多種真菌，但國內(nèi)糞生真菌系統(tǒng)研究、資源調查處于空白，對糞生瘤胃真菌的研究國內(nèi)未見報道。

　　從國外的文獻看出，對糞生真菌的分類描述較多，主要是Acraaiales Sordariaceae Corprinaceae的一些種。在已發(fā)現(xiàn)糞生真菌中，包括接合菌門的Chaetocladium、Mucor、Pilaria、Pilobolus等屬，子囊菌門Ascobolus、Ascozonus、Chaetomium、Coniochaeta、Coprobia、Delitschia、Gymnoascua、Lasiobolus、Melanospora、Microascus、Orbilia、Podospora、 Pseudeurotium、Ryparobious、Saccobolus、Sordaria、Sporomiella、Thelebolus、Trichobolus Wawelia等屬，擔子菌門Coprinus、Cyathus、Panaeolus、Psilocybe、Sphaerobolus、Sporobolomyces、Stropharia等屬，半知菌類Alternaria、Arthrobotrys、Aspergilus、Doratomyces、Geotrichum、Gliocladium、Gliomastix、Graphium、Isaria、Oedocephalum、Omychophora、Penicillium、 Stachybotrys、Stibella、Trchothecium、Verticillium、Volutella等屬。糞生的粘菌(Myxomycetes) 中報道的真菌有80多種,其中一些種專主腐生于糞便上。瘤胃厭氧真菌的種類描述較少，主要為Caecomyces Neocallimastix Oprinomyces Piromyces Ruminomyces等屬的真菌。對糞生瘤胃真菌的調查、系統(tǒng)研究較少，只在幾個屬內(nèi)有所描述。Bell 給Podospora屬的部分種列出了分類檢索表（Bell,A.et al.,1995,1996,1997）。

　　微生態(tài)調節(jié)作用

　　國內(nèi)外的諸多動物營養(yǎng)領域的文獻從微生態(tài)平衡的角度闡述調節(jié)腸道內(nèi)真菌、細菌等種群數(shù)量變化含量對動物營養(yǎng)水平的有重要的影響。在反芻動物和馬屬動物中，粗纖維在瘤胃及盲腸中經(jīng)微生物作用（細菌、真菌和原生動物等）發(fā)酵形成的揮發(fā)性脂肪酸（乙酸、丙酸、丁酸）參與體內(nèi)的碳水化合物代謝，通過三羧酸循環(huán)，形成高能磷酸化合物，產(chǎn)生熱能。最近十幾年，隨著動物營養(yǎng)生理研究的進展，逐漸發(fā)現(xiàn)溜胃真菌對于在粗飼料中占主導地位的植物結構性物質的降解可能是非常重要的。Dawson和HoPkin的試驗測定了瘤胃微生物在純培養(yǎng)時和與特定酵母菌系協(xié)培養(yǎng)時的生長和活性，發(fā)現(xiàn)幾種酵母菌株可刺激纖維分解菌和乳酸利用菌的生長，而其它菌株的這種能力十分有限。Newbold等研究發(fā)現(xiàn)，釀酒酵母菌株NCYC240、NCYC1026和商業(yè)制劑Yea－sacc能刺激瘤胃模擬裝置中總厭氧菌和纖維分解菌的生長，但NCYC694和NCYC1088無此功能。進一步的體內(nèi)試驗證明，盡管NCYC240、NCYC 1026和Yea－Sacc對綿羊瘤胃總厭氧菌和纖維分解菌有刺激作用，但只有NCYC1026對總厭氧菌和 NCYC240對纖維分解菌的刺激作用達到顯著水平。

　　利用食線蟲真菌（食線蟲真菌是指寄生、捕捉、定殖和毒害線蟲的一類微生物）防治動物線蟲病在丹麥、澳大利亞等國家己取得了一些令人鼓舞的進展。Gronvod等給放牧羊、牛服用食線蟲真菌一段時間后，多種寄生線蟲的感染強度下降，增重獲得較大改善(Gronvod J. et al. 1996, Gronvod J. et al.1993)。Bauchop等（1979）研究指出，真菌是瘤胃微生物中的一類功能菌，它們廣泛地集群于植物纖維內(nèi)，絕大多數(shù)為纖維分解菌。Wood等（1991）指出，纖維分解菌(Nencallimatix fralisnta)可以分泌一種專門消化胞外纖維素的活性纖維酶復合物，這是迄今在瘤胃有機物中發(fā)現(xiàn)的的胞外纖維消化酶。有眾多的研究顯示，瘤胃真菌可產(chǎn)生纖維分解酶、半纖維素分解酶和木聚糖酶等13種酶。Gloer 和Weber從糞生真菌Poronia punctata和Preussia fleishhakki的代謝產(chǎn)物中可以生產(chǎn)抗真菌的多肽和氨基酸,（Gloer, J. B. 1988; Weber, H. A. 1988）。Zaragozic Acid也是首先從 Sporormiella intermedia和一些糞生真菌中獲得。繆作清等人從新鮮牛糞中分離的食線蟲真菌用于防治動物線蟲病(秦澤榮,2001)。

　　研究意義

　　微生物的次生代謝產(chǎn)物作為藥物應用絕不僅限于抗生素，它們中的不少次生代謝產(chǎn)物還能通過與脊椎動物特定的受體或酶相互作用而調節(jié)細胞的活性。從真菌，特別是子囊菌亞門的某些類群的次生代謝產(chǎn)物中，尋找非抗菌素的酶抑制劑、受體抑制劑或激活劑和免疫調節(jié)劑等低分子代謝產(chǎn)物，已成為一個十分受人關注的熱點。近年的統(tǒng)計資料表明從微生物來源的11類生理活性物質中，從灰色鏈霉菌(Streptomyces griseus)得到的占170種，吸水鏈霉菌(S.hygrosco -picus)占264種，諾卡氏菌中的一些種(Nocardia spp.)占219種，而在真菌中僅曲霉和青霉屬就達到282種（梁宗琦. 1999）。糞生真菌也是一非常重要的產(chǎn)生生理活性物質的資源，Gloer 和Weber分別從糞生真菌Poronia punctata和Preussia fleishhakki的菌株代謝產(chǎn)物中分離到了抗真菌的多肽、氨基酸。（Gloer,J.B.1988; Weber,H.A.1988）

　　糞生瘤胃真菌能夠通過動物消化道，經(jīng)過多種酶的作用而能夠存活，這種*性可能賦含糞生瘤胃真菌一些*性質，如產(chǎn)生特殊組織，或產(chǎn)生特殊酶、抗生素等性狀，因此在分類地位上、酶制劑、抗生素及纖維素降解領域應用方面潛力巨大。糞生真菌及瘤胃真菌對降解纖維素、木質素、難降解物質、環(huán)境中的有毒有害物質的研究有直接的推動作用。自然界纖維素的含量最高，全國每年作物秸稈產(chǎn)出量高達6.5億t左右，秸稈中纖維素、半纖維素約占秸稈總量的70-80%，秸稈快速降解利用是科技界亟待解決的問題，糞生真菌的多樣性、系統(tǒng)研究有助于在秸稈高效飼料、肥料化等方面提供一個解決的思路。