瑞孚迪LabChip GX Touch核酸分析系統(tǒng)你會(huì)用么?
LabChip® GX Touch™核酸分析儀采用微流控毛細(xì)管電泳分離技術(shù)可以快速完成DNA和RNA的核酸片段大小及濃度檢測(cè),生成可重復(fù)的高分辨率數(shù)據(jù)。并且,采用便捷的觸摸屏操作界面,即使新手,也能快速進(jìn)行準(zhǔn)備工作和樣品運(yùn)行,簡(jiǎn)化了傳統(tǒng)電泳過程的諸多繁瑣步驟。

一、工作原理
LabChip GX Touch檢測(cè)試劑盒基于傳統(tǒng)的凝膠電泳原理,這些原理已轉(zhuǎn)換為芯片形式。芯片格式大大縮短了分離時(shí)間,并以數(shù)字格式提供自動(dòng)定量信息。

該芯片包含一組互連的微通道,這些微通道連接分離通道和緩沖孔。其中一個(gè)微通道連接到一個(gè)短毛細(xì)管,該毛細(xì)管以90°角從芯片底部延伸。在測(cè)定過程中,毛細(xì)管從微孔板的孔中吸取樣品。

芯片中的某些通道比其他通道大。較大的通道包含緩沖區(qū)。在芯片制備過程中,較小的通道和一些孔中填充有篩分凝膠和緩沖液。通道填滿后,芯片起到集成電路的作用。

該電路由電極塊中的七個(gè)電極驅(qū)動(dòng),當(dāng)前門關(guān)閉時(shí),這些電極與芯片孔中的溶液接觸。每個(gè)電極都連接到一個(gè)獨(dú)立的電源,可提供最大的控制和靈活性。

填充芯片中較小通道的聚合物設(shè)計(jì)用于在通過電泳驅(qū)動(dòng)DNA/RNA片段或蛋白質(zhì)通過其時(shí)按大小篩選DNA/RNA片段或蛋白質(zhì),類似于使用瓊脂糖或聚丙烯酰胺凝膠。

樣品和篩分緩沖液還含有熒光染料,在與雙鏈 DNA、RNA 或蛋白質(zhì)/SDS復(fù)合物結(jié)合后會(huì)變得更亮。

在芯片中,通過負(fù)壓從微孔板中抽取每個(gè)樣品,直到將足夠數(shù)量的樣品加載到芯片中。然后將樣品電泳移動(dòng)到中央通道中。當(dāng)片段沿著中心通道向下移動(dòng)時(shí),它們按大小分離,然后通過激光,激光激發(fā)與分子結(jié)合的熒光染料。該軟件繪制熒光強(qiáng)度隨時(shí)間的關(guān)系圖,并為每個(gè)樣品生成電泳圖。

可以在凝膠選項(xiàng)卡上以凝膠狀格式查看數(shù)據(jù),以實(shí)現(xiàn)平板凝膠的外觀。(凝膠的顏色可以改變。

對(duì)于DNA、RNA、蛋白質(zhì)和聚糖測(cè)定,定量濃度和準(zhǔn)確定量每個(gè)片段的大小是通過ladder和內(nèi)標(biāo)確定各條帶的大小和濃度。
吸入芯片的樣品量取決于pH值、鹽濃度和緩沖液添加劑。內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)對(duì)這些因子進(jìn)行歸一化,以便軟件可以使用標(biāo)準(zhǔn)品曲線面積與未知峰的比值直接確定濃度。
在各樣品分析之間清洗吸管,從而消除了交叉污染或殘留。
二、儀器描述
1、儀器前視圖

1)Touch Screen
觸摸屏:顯示控制儀器的軟件。
2)Power Button
電源按鈕:打開儀器和觸摸屏。儀器開啟時(shí)亮起。要關(guān)閉儀器,請(qǐng)?jiān)赪indows桌面上選擇“開始”-->“關(guān)機(jī)”以關(guān)閉軟件。使用電源按鈕關(guān)閉儀器可能會(huì)導(dǎo)致文件損壞。僅在緊急情況下或計(jì)算機(jī)已鎖定時(shí)使用。
3)Status Indicator Lights
狀態(tài)指示燈:指示儀器狀態(tài)。
未亮-電源關(guān)閉。
綠色常亮-電源已打開,GX Touch 軟件處于活動(dòng)狀態(tài),但儀器處于空閑狀態(tài)。
綠色閃爍-運(yùn)行檢測(cè)或Protein Clear HR/Protein EXact校準(zhǔn)。
黃色常亮-電源已打開,但GX Touch軟件未在Windows中運(yùn)行。
紅色常亮-電源已打開,GX Touch軟件處于活動(dòng)狀態(tài),但無法與儀器通信。
紅色閃爍-儀器無法執(zhí)行LabChip GX Touch軟件發(fā)出的操作。
4)Front Door
使用LabChip GX Touch軟件打開前門。當(dāng)門打開時(shí),會(huì)顯示一條消息,提醒用戶執(zhí)行適當(dāng)?shù)牟僮鳌?/p>
2、連接接口
1)電源

2)側(cè)面連接器
側(cè)面連接器用于將外圍設(shè)備(如鼠標(biāo)、鍵盤或外部顯示器)連接到LabChip GX Touch/GXII Touch儀器,并將儀器連接到網(wǎng)絡(luò)。

VGA Monitor Port:VGA 顯示器端口,用于將儀器連接到外部顯示器。
3、DNA, RNA, and Protein Chips
1)Top of Chip

2)Bottom of Chip

3)芯片接口

芯片接口固定芯片,為芯片通道提供電壓以加載、進(jìn)樣和分離樣品,提供壓力以用分離凝膠灌注芯片,并為芯片孔提供真空以將樣品從微孔板吸入芯片。芯片接口還包含一個(gè)加熱元件,用于在芯片的微流控通道中保持恒定溫度,并提供光學(xué)黑光束轉(zhuǎn)儲(chǔ),以提高靈敏度并幫助熒光檢測(cè)。

Lid:固定電極和O形圈以提供電壓和對(duì)芯片施加壓力。
Optics lens:用于激光照亮芯片的透鏡。
Optical Beam Dump:在芯片下方提供光學(xué)暗背景。
Pressure Plate with Heating Element:在芯片的微流控通道中保持恒定的溫度。
Electrodes:向芯片施加電壓,使流體通過芯片,并驅(qū)動(dòng)芯片通道中的電泳分離。
O-Rings:在芯片接口蓋和芯片之間建立密封,以對(duì)孔施加壓力或真空。
Pressure Port:提供壓力(正壓或負(fù)壓)以灌注芯片或?qū)悠芬七^芯片。
4)核酸Chips

5)蛋白Chips

4、微孔板載體

三、軟件介紹
1、LabChip GX Touch主窗口

1)Views
“視圖”按鈕 - 打開“視圖”窗口以查看上次完成運(yùn)行的數(shù)據(jù)。使用LabChip GX Reviewer軟件查看或分析先前運(yùn)行的數(shù)據(jù)。
2)Prime and Calibrate Window

Change Assay Folder:更改檢測(cè)文件夾按鈕,輕觸以選擇包含所需檢測(cè)的文件夾。
Prime and Calibrate:?jiǎn)?dòng)和校準(zhǔn)按鈕,開始校準(zhǔn)過程。
2、Run Window
1)Select Wells Tab

Import Run File:“導(dǎo)入運(yùn)行文件”按鈕,打開“從XML文件導(dǎo)入運(yùn)行參數(shù)”窗口以選擇要導(dǎo)入的運(yùn)行文件。
2)Setup Run Tab

Skip Warm:跳過熱,僅顯示 Protein EXact 芯片在運(yùn)行前已預(yù)熱的情況。如果選擇此選項(xiàng),則不會(huì)重復(fù)預(yù)熱過程。
3)Start Run Tab

Chip Status:芯片狀態(tài),顯示檢測(cè)類型、芯片試劑過期時(shí)間、芯片過期日期和芯片壽命。
4)Status Window

使用“狀態(tài)”窗口可在操作運(yùn)行期間或操作完成后查看啟動(dòng)、儀器校準(zhǔn)、清洗或運(yùn)行的狀態(tài)。
Assay:儀器將要校準(zhǔn)的檢測(cè)的名稱。
Status:狀態(tài),正在進(jìn)行的操作的當(dāng)前步驟。對(duì)于已完成的操作,顯示上次操作的狀態(tài)。
3、Tools Window

使用“工具”窗口指定數(shù)據(jù)導(dǎo)出設(shè)置、查看或添加孔板、運(yùn)行軟件IQ、運(yùn)行診斷以及校準(zhǔn)光學(xué)元件。
4、Views Window

使用“視圖”窗口可以查看正在進(jìn)行的運(yùn)行或校準(zhǔn)中已完成的樣本孔的數(shù)據(jù),或以前已完成的運(yùn)行或校準(zhǔn)??梢栽贕X Touch軟件中查看數(shù)據(jù)并更改某些分析設(shè)置。
1)Egram/Gel Tab

在孔完成后,使用 EGram/Gel 選項(xiàng)卡查看分析孔數(shù)據(jù)的電泳圖和凝膠。
2)EGram Tab

EGram選項(xiàng)卡是每個(gè)孔數(shù)據(jù)的可視化表示。
3)Gel Tab

四、樣本檢測(cè)
1、準(zhǔn)備儀器以運(yùn)行樣本
1)打開LabChip GX Touch軟件。
2)清潔電極和O形環(huán)。
3)吹掃壓力管線。
4)如有必要,校準(zhǔn)光學(xué)器件并運(yùn)行診斷程序。
5)準(zhǔn)備用于檢測(cè)的芯片。
6)將芯片插入儀器。
7)對(duì)于蛋白質(zhì)清除"HR芯片,校準(zhǔn)儀器以運(yùn)行蛋白清晰HR測(cè)定(見第26頁)。
8)如有需要,在運(yùn)行開始前對(duì)芯片進(jìn)行預(yù)處理(不適用于Protein Clear HR芯片)。
9)為檢測(cè)準(zhǔn)備樣品板、梯子和緩沖器。如果您的儀器配備了條形碼閱讀器,請(qǐng)“在板上放置條形碼”以便在樣品板上使用條形碼。
10)如果需要,定義一個(gè)新的板類型,以使用軟件中列出的板以外的板。
11)將樣品板、梯子管和緩沖管裝入儀器中。
2、運(yùn)行檢測(cè)
1)完成準(zhǔn)備儀器以運(yùn)行樣品部分中的步驟。
2)定義分析運(yùn)行的參數(shù)。
3)監(jiān)控運(yùn)行。
4)如果需要,請(qǐng)?jiān)谶\(yùn)行期間編輯分析參數(shù)。
5)拆下平板、緩沖管和梯子管。
6)卸下芯片,根據(jù)分析用戶指南中的說明存儲(chǔ)芯片。
7)如有必要,在再次運(yùn)行芯片之前立即清洗芯片。
3、數(shù)據(jù)分析
1)RNA分析
LabChip Touch平臺(tái)提供了易于理解的RNA濃度以及核糖體RNA的比例,與RNA質(zhì)量評(píng)分(RQS)共同用作完整性評(píng)價(jià)指標(biāo)

除RQS值外,分析軟件現(xiàn)在可以自動(dòng)計(jì)算DV200 值。
2)基因組DNA樣品
為L(zhǎng)abchip GX Touch系統(tǒng)開發(fā)的基因組DNA實(shí)驗(yàn)創(chuàng)新性的引入了基因組DNA質(zhì)量評(píng)分(GQS)。

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