總 RNA 提取試劑:高質(zhì)量 RNA 獲取的關(guān)鍵工具
裂解與保護(hù)成分:除異硫氰酸胍外,部分總 RNA 提取試劑還包含 β - 巰基乙醇,其作為強(qiáng)還原劑,能進(jìn)一步破壞 RNase 中的二硫鍵,協(xié)同增強(qiáng)對(duì) RNase 的抑制效果,確保 RNA 在提取過(guò)程中不被降解 。此外,試劑中的緩沖體系(如 Tris - HCl)維持提取過(guò)程中的 pH 穩(wěn)定,通常將 pH 控制在酸性范圍(約 pH 4.5 - 5.5),此環(huán)境下 DNA 更易分配至有機(jī)相,有助于 RNA 與 DNA 的有效分離。
純化輔助成分:異丙醇常用于沉淀水相中的 RNA。在加入異丙醇后,RNA 分子因溶解度降低而析出,通過(guò)離心可形成 RNA 沉淀,便于后續(xù)收集 。75% 乙醇則用于洗滌 RNA 沉淀,去除殘留的鹽離子和有機(jī)試劑,減少雜質(zhì)對(duì) RNA 質(zhì)量的影響,獲得純度較高的總 RNA。
動(dòng)物組織樣本:取適量新鮮或液氮凍存的動(dòng)物組織(如 50 - 100 mg),置于預(yù)冷的研缽中,加入液氮迅速研磨成粉末狀。將研磨后的組織粉末轉(zhuǎn)移至含有適量總 RNA 提取試劑的離心管中,劇烈振蕩 15 - 30 秒,使組織與試劑充分混合,室溫靜置 5 分鐘,確保細(xì)胞充分裂解 。加入氯仿后,振蕩混勻,室溫離心(12000 rpm,15 分鐘),此時(shí)溶液分為三層,RNA 位于上層水相。小心吸取水相至新的離心管,加入異丙醇沉淀 RNA,再次離心收集 RNA 沉淀,用 75% 乙醇洗滌后晾干,最后用適量 RNase - free 水溶解 RNA。
植物組織樣本:由于植物細(xì)胞具有細(xì)胞壁,可先將植物組織(如葉片、幼芽)在液氮中研磨成細(xì)粉,后續(xù)操作與動(dòng)物組織類似 。但部分植物組織富含多糖、多酚等次生代謝物,可能干擾 RNA 提取。可在提取過(guò)程中加入 PVP(聚乙烯吡咯烷酮)等吸附劑,或通過(guò)高鹽低 pH 值緩沖液洗滌等方法去除雜質(zhì),提高 RNA 純度。
細(xì)胞樣本:對(duì)于貼壁細(xì)胞,吸去培養(yǎng)基后,直接在培養(yǎng)板中加入適量總 RNA 提取試劑,用槍頭反復(fù)吹打使細(xì)胞裂解,將裂解液轉(zhuǎn)移至離心管;懸浮細(xì)胞則先離心收集細(xì)胞,再加入試劑裂解 。后續(xù)步驟與組織樣本提取相同,通過(guò)氯仿抽提、異丙醇沉淀和乙醇洗滌獲得 RNA 樣本。
試劑儲(chǔ)存與使用規(guī)范:嚴(yán)格按照產(chǎn)品說(shuō)明書儲(chǔ)存總 RNA 提取試劑,避免高溫、光照和反復(fù)凍融,防止試劑成分失效 。使用前將試劑平衡至室溫,操作過(guò)程中佩戴手套、口罩,使用 RNase - free 的耗材,避免外源 RNase 污染樣本,影響 RNA 質(zhì)量 。
樣本處理細(xì)節(jié):確保樣本新鮮,避免長(zhǎng)時(shí)間放置導(dǎo)致 RNA 降解。對(duì)于凍存樣本,需在液氮或干冰條件下運(yùn)輸和保存 。在研磨組織樣本時(shí),要迅速充分,防止樣本融化;細(xì)胞裂解過(guò)程中,保證細(xì)胞裂解,可適當(dāng)延長(zhǎng)振蕩或吹打時(shí)間 。
優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件:不同生物樣本的成分和結(jié)構(gòu)存在差異,可通過(guò)預(yù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化試劑用量、裂解時(shí)間、離心條件等參數(shù) 。對(duì)于 RNA 含量較低或雜質(zhì)較多的樣本,可增加樣本起始量或采用多次洗滌、純化步驟,提高 RNA 提取質(zhì)量。
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