乳酸化驅(qū)動的NUPR1促進肝細(xì)胞癌中腫瘤浸潤巨噬細(xì)胞的免疫抑制效應(yīng)
《Advanced science》是Wiley出版集團旗下的一本開放獲取(Open Access)綜合性學(xué)術(shù)期刊,于2014年創(chuàng)刊。在中科院最新升級版分區(qū)表中,大類學(xué)科為材料科學(xué)1區(qū),小類學(xué)科中化學(xué)綜合為1區(qū)、納米科技為2區(qū)、材料科學(xué)綜合為1區(qū),屬于TOP期刊?!禔dvanced science》是一本跨學(xué)科開放獲取期刊,涵蓋材料科學(xué)、物理和化學(xué)、醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)以及工程學(xué)等領(lǐng)域,主要發(fā)表這些領(lǐng)域的一liu基礎(chǔ)和應(yīng)用研究成果。
出版周期:12 issues/year;
影響因子:14.1;
ISSN:2198-3844;
發(fā)文量:3290篇/年;
審稿速度:平均12周;
版面費:USD 5270.00;
一、研究背景與目標(biāo)
HCC 是全球致死率最高的癌癥之一,傳統(tǒng)肝切除術(shù)后復(fù)發(fā)率高,而PD-1/PD-L1免疫治療響應(yīng)率僅 15-30%。其核心瓶頸在于腫瘤微環(huán)境(TME)的免疫抑制,尤其是TAMs的異常極化(向M2型轉(zhuǎn)化)會抑制T細(xì)胞功能。本研究旨在探索TAMs中NUPR1的作用及機制。
二、關(guān)鍵技術(shù)總結(jié)
研究通過多種實驗技術(shù)解析NUPR1在肝癌腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)中的作用及機制,具體如下:
1、組學(xué)分析
單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq):對人及小鼠肝癌組織的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(GSE149614、GSE232182等數(shù)據(jù)集)進行整合分析,鑒定NUPR1在TAMs中的特異性高表達,區(qū)分NUPR1高/低表達巨噬細(xì)胞亞群,并通過基因集富集分析(GSEA)揭示其功能差異(如免疫抑制通路富集)。利用UMAP可視化細(xì)胞聚類,結(jié)合Harmony算法校正批次效應(yīng),確保跨數(shù)據(jù)集分析的一致。
空間轉(zhuǎn)錄組(ST)分析:對肝癌組織空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(GSE238264)進行分析,驗證NUPR1與巨噬細(xì)胞標(biāo)志物CD68 在腫瘤區(qū)域的共定位,明確其在腫瘤微環(huán)境中的空間分布特征。
bulk RNA-seq與多數(shù)據(jù)庫整合:整合 TCGA、GEO、ICGC 等數(shù)據(jù)庫的bulk RNA-seq數(shù)據(jù),構(gòu)建NUPR1?巨噬細(xì)胞特征基因集,關(guān)聯(lián)其表達與患者預(yù)后及免疫治療響應(yīng)
2、巨噬細(xì)胞極化和共培養(yǎng)模型
通過腫瘤條件培養(yǎng)基(TCM)誘導(dǎo)THP-1細(xì)胞或骨髓來源巨噬細(xì)胞(BMDMs)向TAMs極化,結(jié)合NUPR1抑制劑(TFP-2HCL、ZZW-115-2HCL)或shRNA敲低技術(shù),研究NUPR1 對巨噬細(xì)胞表型的調(diào)控
建立巨噬細(xì)胞與CD8?T細(xì)胞共培養(yǎng)體系,通過流式細(xì)胞術(shù)檢測T細(xì)胞功能標(biāo)志物(IFN-γ、Gzmb、PD-1),評估NUPR1對T細(xì)胞耗竭的影響
3、基因與蛋白水平檢測
定量實時PCR(qRT-PCR):檢測巨噬細(xì)胞中M1/M2 標(biāo)志物(如iNOS、CD86、CD206、ARG1)及NUPR1、PD-L1等基因的表達水平,驗證NUPR1對極化表型的調(diào)控。
Western blotting:分析 ERK、JNK等MAPK通路蛋白的磷酸化水平,以及組蛋白乳酸化(H3K18la)、NUPR1等蛋白表達,揭示分子調(diào)控機制。
染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP):通過ChIP-qPCR驗證乳酸誘導(dǎo)的H3K18la在NUPR1啟動子區(qū)域的富集,證實組蛋白乳酸化對NUPR1轉(zhuǎn)錄的激活作用
4、動物模型與體內(nèi)實驗技術(shù)
皮下移植瘤模型:將Hepa1-6細(xì)胞接種于C57BL/6小鼠腋窩,評估NUPR1抑制劑對腫瘤生長、巨噬細(xì)胞極化及T細(xì)胞浸潤的影響。
原位肝癌模型:通過hydrodynamic尾靜脈注射攜帶c-Myc和Ctnnb-N90質(zhì)粒的溶液誘導(dǎo)小鼠肝臟自發(fā)性腫瘤,模擬更接近臨床的腫瘤微環(huán)境。
巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移實驗:將經(jīng)TFP-2HCL預(yù)處理的BMDMs瘤內(nèi)注射,驗證靶向巨噬細(xì)胞NUPR1對腫瘤生長的抑制作用。
免疫治療聯(lián)合實驗:在小鼠模型中聯(lián)合使用NUPR1抑制劑(TFP-2HCL或ZZW-115-2HCL)與PD-1單克隆抗體,通過腫瘤體積監(jiān)測、流式細(xì)胞術(shù)及IHC染色,評估聯(lián)合治療對免疫微環(huán)境的改善效果。
5、病理與影像技術(shù)
多重免疫熒光(mIF):檢測腫瘤組織中NUPR1?CD68?巨噬細(xì)胞與CD8?T細(xì)胞的共定位及數(shù)量變化,關(guān)聯(lián)免疫治療響應(yīng)。
免疫組化(IHC):分析腫瘤組織中CD206、iNOS、CD8、PD-1等標(biāo)志物的表達,評估巨噬細(xì)胞極化和T細(xì)胞浸潤狀態(tài)。
影像評估:通過磁共振成像(MRI)監(jiān)測肝癌患者免疫治療前后的腫瘤變化,關(guān)聯(lián)NUPR1?巨噬細(xì)胞水平與治療響應(yīng)。
三、主要研究結(jié)果
1、NUPR1在HCC腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)中高表達且參與HCC進展
通過多維度分析揭示NUPR1在肝癌(HCC)腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)中的表達特征及臨床意義。scRNA-seq數(shù)據(jù)顯示,與正常肝組織相比,HCC腫瘤組織中巨噬細(xì)胞比例顯著升高,T/NK細(xì)胞比例減少。差異基因分析發(fā)現(xiàn)NUPR1是腫瘤與正常組織巨噬細(xì)胞的核心差異基因,且在腫瘤巨噬細(xì)胞中高表達??缥锓N驗證顯示,小鼠HCC模型中NUPR1同樣主要在巨噬細(xì)胞中表達??臻g轉(zhuǎn)錄組證實NUPR1與CD68在腫瘤區(qū)域共定位,且隨巨噬細(xì)胞浸潤腫瘤時間動態(tài)上調(diào)。臨床數(shù)據(jù)表明,NUPR1?巨噬細(xì)胞特征基因在腫瘤組織中富集,其高表達與HCC患者更低的總生存率、更高的復(fù)發(fā)率顯著相關(guān),是術(shù)后預(yù)后的獨立預(yù)測因子。且僅巨噬細(xì)胞中NUPR1表達與預(yù)后相關(guān),整體NUPR1表達分層無顯著差異,強調(diào)其細(xì)胞特異性作用。結(jié)果明確了NUPR1在HCC TAMs中特異性高表達的特征,并證實其作為不良預(yù)后標(biāo)志物的臨床價值。
圖1、NUPR1在HCC TAMs中高表達
2、NUPR1對巨噬細(xì)胞表型及功能的調(diào)控作用
通過對NUPR1高/低表達巨噬細(xì)胞的分析,發(fā)現(xiàn)NUPR1高表達巨噬細(xì)胞富集免疫抑制通路,而低表達組富集免疫激活通路。表型上,NUPR1高表達巨噬細(xì)胞呈M2型特征(高表達ARG1、TREM2等),并高表達PD-L1、SIRPA等免疫檢查點;低表達組則呈M1型特征(高表達 CD80、IL1B等)。NUPR1抑制劑TFP-2HCL處理后,THP1細(xì)胞和BMDMs的M1標(biāo)志物(iNOS、CD86)表達升高,M2 標(biāo)志物(CD206、ARG1)表達降低,巨噬細(xì)胞形態(tài)從M2 樣紡錘形轉(zhuǎn)向M1樣圓形。臨床樣本mIF染色顯示腫瘤組織中NUPR1?CD68?細(xì)胞更多,且其低表達患者預(yù)后更好,證實NUPR1在巨噬細(xì)胞極化及預(yù)后中的關(guān)鍵作用。
圖2、NUPR1在巨噬細(xì)胞中維持免疫抑制表型
3、NUPR1通過抑制MAPK通路調(diào)控巨噬細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換的機制
基因集富集分析(GSEA)顯示,NUPR1低表達巨噬細(xì)胞中MAPK信號通路顯著富集,其通路評分顯著高于NUPR1高表達組。UMAP可視化進一步證實,NUPR1高表達區(qū)域?qū)?yīng)更低的MAPK通路活性,且NUPR1表達與MAPK通路評分呈顯著負(fù)相關(guān)。KEGG分析顯示,NUPR1抑制劑TFP-2HCL處理的THP1細(xì)胞中MAPK通路顯著激活,ssGSEA驗證其通路評分升高。Western blot結(jié)果表明,TFP-2HCL處理或NUPR1敲低后,THP1細(xì)胞和骨髓來源巨噬細(xì)胞(BMDMs)中ERK和JNK磷酸化水平顯著增加,但p38磷酸化無明顯變化。功能實驗顯示,TFP-2HCL可誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞從M2型向M1型極化,而ERK抑制劑(FR180204)或JNK抑制劑(JNK-IN-8)可逆轉(zhuǎn)這一效應(yīng)。研究結(jié)果證實NUPR1通過抑制ERK和JNK磷酸化抑制MAPK通路,進而維持巨噬細(xì)胞的免疫抑制表型,而靶向NUPR1可激活ERK/JNK通路,促進M1型極化。
圖3、NUPR1通過ERK和JNK通路促進巨噬細(xì)胞表型轉(zhuǎn)換
4、NUPR1?巨噬細(xì)胞對 CD8?T 細(xì)胞功能的影響及機制
scRNA-seq分析顯示,NUPR1高/低表達組的T/NK細(xì)胞比例無顯著差異,但基因表達特征不同:NUPR1高表達組中CD8?T細(xì)胞的細(xì)胞毒性基因低表達,耗竭基因高表達;低表達組則progenitor耗竭基因富集。signature評分顯示,NUPR1高表達組CD8?T細(xì)胞耗竭評分升高,細(xì)胞毒性和progenitor耗竭評分降低。TCGA數(shù)據(jù)證實,NUPR1?巨噬細(xì)胞與耗竭CD8?T細(xì)胞呈強正相關(guān)。共培養(yǎng)實驗中,TFP-2HCL處理的巨噬細(xì)胞可上調(diào)CD8?T細(xì)胞的IFN-γ、Gzmb表達,減少PD-1表達,逆轉(zhuǎn)T細(xì)胞耗竭。而加入ERK抑制劑(FR180204)或JNK 抑制劑(JNK-IN-8)后,TFP-2HCL對CD8?T細(xì)胞的調(diào)控作用被消除。NUPR1?巨噬細(xì)胞通過抑制ERK/JNK通路促進CD8?T細(xì)胞耗竭,靶向NUPR1可通過激活該通路改善T細(xì)胞功能。
圖4、巨噬細(xì)胞中的NUPR1通過ERK和JNK通路促進耗竭性CD8+ T細(xì)胞的耗竭
5、靶向NUPR1對肝癌(HCC)的治療效果及與PD-1抑制劑的協(xié)同作用
在Hepa1-6皮下移植瘤模型中,NUPR1抑制劑TFP-2HCL處理顯著縮小腫瘤體積、降低重量,腫瘤組織中M2標(biāo)志物CD206減少,M1標(biāo)志物iNOS增加,CD8?T細(xì)胞浸潤增多且 PD-1表達降低。hydrodynamic尾靜脈注射誘導(dǎo)的自發(fā)性原位肝癌模型中,TFP-2HCL同樣顯著減輕肝臟腫瘤負(fù)荷,IHC染色顯示類似的免疫微環(huán)境改善。聯(lián)合治療實驗中,TFP-2HCL 與抗PD-1抗體聯(lián)用較單藥更有效抑制腫瘤生長,促進巨噬細(xì)胞M1極化,增加IFN-γ?、Gzmb?CD8?T細(xì)胞,減少PD-1?CD8?T細(xì)胞。
低神經(jīng)毒性的NUPR1抑制劑ZZW-115-2HCL單藥或與PD-1抑制劑聯(lián)用,在自發(fā)性模型中也顯著增強抗腫瘤效率。巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移實驗證實,TFP-2HCL預(yù)處理的巨噬細(xì)胞可抑制腫瘤生長。結(jié)果表明,靶向 NUPR1能重塑免疫微環(huán)境,與PD-1抑制劑協(xié)同增強HCC治療效果。
圖5、抑制NUPR1可增強抗PD-1治療在HCC中的體內(nèi)療效
6、腫瘤來源乳酸通過組蛋白乳酸化上調(diào)巨噬細(xì)胞NUPR1的機制。
Western blot 顯示,與腫瘤條件培養(yǎng)基(TCM)共培養(yǎng)后,THP1細(xì)胞和骨髓來源巨噬細(xì)胞(BMDMs)中 NUPR1 表達顯著升高,且乳酸處理可濃度依賴性增強NUPR1表達。GSE149614 數(shù)據(jù)集分析顯示,NUPR1高表達巨噬細(xì)胞對應(yīng)的腫瘤細(xì)胞 glycolysis評分更高,糖酵解相關(guān)基因表達上調(diào)。TCGA數(shù)據(jù)證實,NUPR1?巨噬細(xì)胞與乳酸轉(zhuǎn)運體SLC16A3呈強正相關(guān)。機制上,TCM或乳酸處理可增加巨噬細(xì)胞中組蛋白H3K18乳酸化水平,同時抑制 ERK和JNK磷酸化。代謝干預(yù)實驗顯示,腫瘤細(xì)胞經(jīng)糖酵解抑制劑(Oxamate、2-DG)處理后,其條件培養(yǎng)基誘導(dǎo) NUPR1表達的能力減弱;而糖酵解促進劑Rotenone則增強該效應(yīng)。ChIP-qPCR證實,TCM或乳酸可通過H3K18乳酸化富集NUPR1啟動子區(qū)域,激活其轉(zhuǎn)錄。綜上,腫瘤細(xì)胞分泌的乳酸通過組蛋白H3K18乳酸化上調(diào)巨噬細(xì)胞NUPR1表達,抑制ERK/JNK通路。
圖6、腫瘤細(xì)胞通過H3K18賴氨酸促進巨噬細(xì)胞中NUPR1的表達。
7、NUPR1?巨噬細(xì)胞與免疫治療耐藥的關(guān)聯(lián)
MRI影像顯示HCC患者PD-1單抗治療的響應(yīng)差異。mIF染色及量化分析表明,非響應(yīng)者(42 例)腫瘤中NUPR1?CD68?細(xì)胞數(shù)量顯著高于響應(yīng)者(33 例),且非響應(yīng)者中CD68?CD206?NUPR1?(M2型)細(xì)胞比例更高。Kaplan-Meier曲線顯示,高NUPR1?CD68?水平的HCC患者總生存期更短。跨癌種分析發(fā)現(xiàn),NSCLC和黑色素瘤中NUPR1主要表達于巨噬細(xì)胞,非響應(yīng)者中其表達顯著升高。多數(shù)據(jù)集驗證顯示NUPR1?巨噬細(xì)胞高表達與耐藥及不良預(yù)后相關(guān),結(jié)果表明,乳酸通過H3K18乳酸化上調(diào)NUPR1并導(dǎo)致免疫抑制。
圖7、NUPR1+巨噬細(xì)胞介導(dǎo)對免疫療法的抗性
四、全文結(jié)論
本研究揭示,核蛋白 1(NUPR1)在肝細(xì)胞癌(HCC)腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(TAMs)中扮演關(guān)鍵角色。NUPR1在TAMs中高表達,與患者不良預(yù)后緊密相關(guān),其可促進M2巨噬細(xì)胞極化,上調(diào)免疫檢查點分子如PD-L1和SIRPA的表達,進而抑制CD8?T細(xì)胞功能,營造免疫抑制性腫瘤微環(huán)境,降低PD-1阻斷治療的響應(yīng)率。機制上,腫瘤來源的乳酸誘導(dǎo)組蛋白 H3K18乳酸化,上調(diào)NUPR1轉(zhuǎn)錄,NUPR1則通過抑制 ERK 和JNK信號通路發(fā)揮免疫抑制作用。通過藥理學(xué)手段抑制NUPR1,可有效逆轉(zhuǎn)M2極化,增強CD8?T細(xì)胞功能。在臨床前模型中,抑制NUPR1與PD-1單抗聯(lián)合使用,顯著抑制腫瘤生長。此外,NUPR1?TAMs可作為預(yù)測免疫治療響應(yīng)的生物標(biāo)志物,為HCC免疫治療耐藥問題提供了新的解決思路,NUPR1有望成為提升HCC免疫治療療效的潛在靶點。
參考文獻:
Cai J, Zhang P, Cai Y, Zhu G, Chen S, Song L, Du J, Wang B, Dai W, Zhou J, Fan J, Yu Y, Dai Z. Lactylation-Driven NUPR1 Promotes Immunosuppression of Tumor-Infiltrating Macrophages in Hepatocellular Carcinoma. Adv Sci (Weinh). 2025 May;12(20): e2413095. doi: 10.1002/advs.202413095. Epub 2025 Apr 30. PMID: 40305758; PMCID: PMC12120759.
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