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用于染色的培養(yǎng)細(xì)胞既可以是貼壁細(xì)胞，也可以是懸浮細(xì)胞。貼壁細(xì)胞通常使其生長在合適的固相支持物上；懸浮細(xì)胞可以直接固定，也可以通過甩片或使用化學(xué)黏合劑黏附在固相支持物上。
（一）貼壁細(xì)胞
貼壁細(xì)胞的準(zhǔn)備比較簡單，可以使其生長于適當(dāng)?shù)妮d玻片、蓋玻片或塑料組織培養(yǎng)皿中。如果實驗要求高分辨率或需拍照，細(xì)胞應(yīng)生長于載玻片或蓋玻片上；如果實驗的分辨率要求不高，或者是大量樣品的篩選，可使細(xì)胞生長于塑料組織培養(yǎng)皿中。
將貼壁細(xì)胞生長在固相支持物上有其*的優(yōu)點，操作步驟，如沖洗、固定、通透及染色均較簡單易行，便于同時進(jìn)行大量不同種類細(xì)胞、不同抗體及不同條件下的操作。
（二）懸浮細(xì)胞
懸浮細(xì)胞的制備可以采用多種不同的方法。如果是進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)部抗原的定位，一般可用甩片機將細(xì)胞甩在一張載玻片上，也可以先用帶電的交聯(lián)劑涂在蓋玻片上，然后再將細(xì)胞黏附于蓋玻片上。此后的操作步驟與貼壁細(xì)胞相同。
在某些情況下，細(xì)胞可在懸浮狀態(tài)下染色。這是因為在其后的操作步驟中，需要細(xì)胞在懸浮狀態(tài)下進(jìn)行，例如細(xì)胞分選。在懸浮狀態(tài)下處理細(xì)胞更加繁瑣，因為每一洗滌步驟均須離心、再懸浮細(xì)胞。
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