揭示RNA所起細(xì)胞作用的計(jì)算機(jī)程序
美國中佛羅里達(dá)大學(xué)助理教授Shaojie Zhang使用一種復(fù)雜的計(jì)算機(jī)程序分析RNA基序，即組成RNA的亞單元。

RNA與DNA和蛋白質(zhì)是生命的三種構(gòu)建單元。知道這三種構(gòu)建單元如何合作和如何發(fā)生偏差將有助于理解是什么導(dǎo)致疾病以及如何治療它們。

多虧人類基因組計(jì)劃，人們已經(jīng)發(fā)現(xiàn)很多關(guān)于DNA的信息，但是關(guān)于RNA方面的信息人們知道不太多。RNA像DNA一樣輔助編碼基因。一些病毒也使用RNA作為它們進(jìn)行復(fù)制的主要遺傳來源。各種各樣的RNA參與所有過程，包括蛋白合成，控制基因表達(dá)和將身體某一部分的細(xì)胞信號傳送到另一部分。

組成RNA的基序像長的手風(fēng)琴那樣進(jìn)行折疊，而且結(jié)構(gòu)可變。在過去，人們已鑒定出很多基序，但是直到現(xiàn)在找出一種快速自動(dòng)化的方法確定不同類型基序的結(jié)構(gòu)模式一直難以實(shí)現(xiàn)。

Zhang說，“我們利用我們開發(fā)的新計(jì)算方法發(fā)現(xiàn)了很多新的RNA結(jié)構(gòu)基序。這一突破能夠極大地增加我們對RNA結(jié)構(gòu)基序的知識。而且新發(fā)現(xiàn)的基序可能有助于我們能夠開發(fā)出治療某些疾病的方法。”

Zhang的研究結(jié)果發(fā)表在Nucleic Acids Research期刊上。

利用計(jì)算機(jī)，Zhang和他的研究小組已能夠觀察這些RNA的類似手風(fēng)琴那樣的結(jié)構(gòu)和它們?nèi)绾卧谌S尺度上進(jìn)行折疊。這種計(jì)算機(jī)程序能夠很快地掃描很多RNA樣品和發(fā)現(xiàn)*的形成結(jié)構(gòu)模式的基序。這種信息能夠給研究人員提供關(guān)于它們功能方面的有用信息。

Zhang說，“這有助于解釋生物如何工作和為什么它有時(shí)發(fā)生錯(cuò)誤，從而導(dǎo)致一些致命性的疾病產(chǎn)生。”