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食品中菌落總數(shù)的測定，目的在于了解食品在生產(chǎn)中，從原料加工到成品包裝受外界污染的情況；也可以應(yīng)用這一方法觀察細(xì)菌在食品中繁殖的動態(tài)，確定食品的保存期，以便對被檢樣品進(jìn)行衛(wèi)生學(xué)評價時提供依據(jù)。
食品有可能被多種類群的微生物所污染，每種細(xì)菌都有它一定的生理特性，培養(yǎng)時應(yīng)用不同的營養(yǎng)條件及其生理條件（如溫度、培養(yǎng)時間、PH值、需氧性質(zhì)等）去滿足其要求，才能分別將各種細(xì)菌培養(yǎng)出來。但在實際工作中，一般都只用一種常用的方法去作菌落總數(shù)的測定，所得結(jié)果，只包括一群能在營養(yǎng)瓊脂上發(fā)育的嗜中溫性需氧菌的菌落數(shù)。
國家標(biāo)準(zhǔn)所規(guī)定的菌落總數(shù)（Berobie bacterial count）就是指食品檢樣經(jīng)過處理，在一定條件下培養(yǎng)后，所得1g或lmL檢樣中所合細(xì)菌菌落的總數(shù)。
食品中菌落總數(shù)的多少，直接反映著食品的衛(wèi)生質(zhì)量。如果食品中菌落總數(shù)多于10萬個，就足以引起紹菌性食物中毒；如果人的感官能察覺食品因細(xì)菌的繁殖而發(fā)生變質(zhì)時，細(xì)菌數(shù)大約已達(dá)到106一107個／g（mL或cm2）。詳見表5—1。
從表中可以看出食品的變質(zhì)反映與菌落總數(shù)的增多有一定，但有時食品中細(xì)菌含量很高，即使已達(dá)到相當(dāng)于同種食品已變質(zhì)時的細(xì)菌數(shù)，而食品并未有任何變質(zhì)現(xiàn)象，這種情況也是經(jīng)常會遇到的。有時食品遭受污染的程度特別嚴(yán)重，食品中雖含有大量的細(xì)菌，由于時間短暫或細(xì)菌繁殖條件不具備，就見不到變質(zhì)現(xiàn)象。例如：細(xì)菌難以生長的一些干制食品和冰凍食品，它們含有細(xì)菌的多少，就可以表明這些食品在生產(chǎn)、運輸、貯藏等過程中衛(wèi)生管理的狀況。
從食品衛(wèi)生觀點來看，食品中菌落總數(shù)越多，說明食品質(zhì)量越差，也就應(yīng)考慮到病原菌污染的可能性愈大；當(dāng)菌落總數(shù)僅少量存在時，則病原菌污染的可能性就會降低，或者幾乎不存在。但也有少數(shù)情況并不*如此，有人曾報道，從市售的一批冰蛋制品中，在所檢出菌落總數(shù)在5000個／g；以下的樣品中，和其中僅含菌落總數(shù)380個／g的樣品中，均可分離出沙門氏菌，并且都有大腸菌群存在。再如，在一些菌落總數(shù)低的食品中（如罐頭食品），曾有細(xì)菌繁殖并已產(chǎn)生了毒素，但是由于環(huán)境條件的限制使細(xì)菌不能延續(xù)生長繁殖，而毒素因性狀穩(wěn)定不受環(huán)境的影響而仍在食品中保留。保這種情況，就不能單憑菌落總數(shù)一項指標(biāo)來評定食品衛(wèi)生質(zhì)量的優(yōu)劣。
還有一些食品，如酸泡菜、發(fā)酵乳等發(fā)酵制品，也不能單憑測定菌落總數(shù)來確定衛(wèi)生質(zhì)量，因為發(fā)酵制品本身就是通過微生物的作用而制成的。根據(jù)以上事實，食品中菌落總數(shù)的測定對評定食品的新鮮度和衛(wèi)生質(zhì)量起著一定的衛(wèi)生指標(biāo)作用，但還必須配合大腸菌群的檢驗和病原菌項目的檢驗，才能作出比較全面準(zhǔn)確評定。
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