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CUT&Tag與ChIP-seq的對比分析:你該選擇哪一個?檢測技術服務詳情介紹

表觀遺傳學研究正以驚人的速度向前發(fā)展,而ChIP-seq和CUT&Tag作為當前zuì主流的兩種染色質(zhì)免疫技術,已成為科研人員探索染色質(zhì)狀態(tài)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、組蛋白修飾的重要工具。然而,很多研究者常常陷入困惑:面對這兩種技術,我究竟應該選擇哪一個?本文將從技術原理、實驗流程、優(yōu)勢與局限等多個角度全面對比CUT&Tag和ChIP-seq,幫助你輕松做出zuì適合自己研究目標的選擇。


一、技術原理對比

1、ChIP-seq機制

ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測序)通過甲醛交聯(lián)固定蛋白與染色質(zhì),再用超聲波將染色質(zhì)打斷成片段,利用特異性抗體捕獲目標蛋白-DNA復合物,zuì后進行測序分析。


2、CUT&Tag機制

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)則直接使用特異性抗體定位目標蛋白,通過偶聯(lián)的Tn5轉(zhuǎn)座酶直接在目標位點附近切割并標記染色質(zhì)DNA片段,避免了復雜的免疫沉淀步驟。


二、實驗流程對比


CUT&Tag與ChIP-seq的對比分


CUT&Tag更適合快速獲得數(shù)據(jù)的場景,尤其適合樣本有限的研究。

ChIP-seq更適合已成熟建立且樣本充足的實驗平臺,尤其是針對難以結(jié)合或特異性較低的抗體。


三、靈敏度與背景噪音對比


CUT&Tag與ChIP-seq的對比分

CUT&Tag的高靈敏度、低背景噪音、精細的分辨率更適合研究精細的染色質(zhì)動態(tài)過程(例如單細胞水平)。

ChIP-seq由于免疫沉淀步驟易產(chǎn)生背景干擾,更適合于大規(guī)模、穩(wěn)定表達蛋白的研究。


四、適用靶點與適用性對比


CUT&Tag與ChIP-seq的對比分

CUT&Tag適合組蛋白修飾和高特異性抗體檢測的轉(zhuǎn)錄因子。

ChIP-seq更適合探測多種復雜轉(zhuǎn)錄因子或低親和力靶標,特別是在足夠細胞數(shù)量時。


五、成本與技術門檻對比


CUT&Tag與ChIP-seq的對比分

CUT&Tag的成本低廉,且適合實驗室初次嘗試表觀遺傳學分析。

ChIP-seq更適合具備成熟技術平臺和資金條件的實驗室,尤其在大量高通量需求下更經(jīng)濟。


在選擇了更適合自己的技術后,關鍵就是要保證實驗質(zhì)量和成功率。百泰派克生物科技深耕生命科學研究領域,擁有穩(wěn)定高效的蛋白A/G-Tn5融合酶及優(yōu)化的一站式CUT&Tag實驗方案,確保每一次實驗高效jīngzhǔn,幫助科研人員輕松完成從實驗設計到數(shù)據(jù)分析的全流程。無論是新手還是進階用戶,百泰派克生物科技都能為您提供可靠的實驗方案、技術支持和全面服務,幫助您快速掌握CUT&Tag技術,輕松實現(xiàn)表觀遺傳研究目標。


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。


※服務優(yōu)勢:

1.采用目前世界上*的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。


※服務優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務優(yōu)勢:

1.技術*,*技術空白

采用金屬標記抗體技術,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

CUT&Tag與ChIP-seq的對比分




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;

5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!



CUT&Tag與ChIP-seq的對比分析:你該選擇哪一個?檢測技術服務詳情介紹


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