高效C端測(cè)序策略：提升準(zhǔn)確性與靈敏度檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì的C端（C-terminus）不僅決定了其在細(xì)胞內(nèi)的定位、穩(wěn)定性及活性，還參與多種關(guān)鍵生物過(guò)程，如泛素化降解、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控、剪切激活等。相較于蛋白N端，C端的結(jié)構(gòu)更為多樣，且常常涉及翻譯后修飾或與其他分子相互作用，是探索新型藥物靶點(diǎn)、揭示疾病機(jī)制的重要入口。然而，C端肽段的檢測(cè)一直面臨技術(shù)瓶頸。傳統(tǒng)dànbáizhì組學(xué)方法難以有效富集和解析C端信息，原因包括酶解位點(diǎn)分布不均、肽段長(zhǎng)度短、質(zhì)譜響應(yīng)性低等。如何構(gòu)建一套高靈敏、高特異、高通量的Cduāncèxù策略，成為當(dāng)前dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域的重要課題。

一、Cduāncèxù的技術(shù)難點(diǎn)

1、非特異性酶解干擾C端識(shí)別

常用的yídànbáiméi（Trypsin）在堿性氨基酸殘基（K、R）處切割，產(chǎn)生的肽段常包含中間區(qū)域信息。由于C端多為酸性或非極性殘基，缺乏特異性酶切位點(diǎn)，導(dǎo)致測(cè)序過(guò)程中C端肽段容易被其他中間肽段“淹沒(méi)”，影響識(shí)別效率。

2、C端肽段性質(zhì)復(fù)雜，質(zhì)譜響應(yīng)性低

C端肽段常常短小、疏水，或者存在翻譯后修飾（如羧基酰胺化、磷酸化），這使得其在質(zhì)譜中離子化效率差、信噪比低，即便被捕獲也難以高置信度鑒定。

3、缺乏靶向富集策略

大多數(shù)dànbáizhì組學(xué)策略依賴全肽段非選擇性分析，缺乏專一富集C端的手段，導(dǎo)致覆蓋率和特異性難以兼顧。

二、化學(xué)標(biāo)簽策略：實(shí)現(xiàn)C端肽段高效富集

為解決上述挑戰(zhàn)，研究者開(kāi)發(fā)了多種基于化學(xué)標(biāo)記與純化的C端富集方法，主要分為以下兩類：

1、羧基選擇性修飾與阻斷

利用羧基選擇性反應(yīng)（如2-PCA、EDC/NHS耦合）可在蛋白C端或肽段羧基位置添加特定標(biāo)簽。這些標(biāo)簽可進(jìn)一步用于純化、富集、或者阻斷非目標(biāo)位點(diǎn)的反應(yīng)，從而提高C端特異性。

2、固相結(jié)合與選擇性洗脫

通過(guò)化學(xué)修飾后將C端肽段固定于固相載體（如親和樹脂、磁珠），在酶解或洗脫過(guò)程中選擇性釋放C端肽段。這種方法可有效剔除背景中間肽段，提高目標(biāo)識(shí)別率。

??這些策略不僅提升了C端肽段的相對(duì)豐度，還大大增強(qiáng)了質(zhì)譜檢測(cè)靈敏度，為下游高通量分析創(chuàng)造條件。

三、質(zhì)譜平臺(tái)升級(jí)：從DDA到DIA的跨越

1、DIA模式下C端識(shí)別更全面

Data-Independent Acquisition（DIA）技術(shù)近年來(lái)快速發(fā)展，其全譜采集模式顯著提升了低豐度肽段的檢測(cè)能力。相比傳統(tǒng)的Data-Dependent Acquisition（DDA），DIA不再依賴采集強(qiáng)度選擇目標(biāo)，而是對(duì)所有肽段信號(hào)一網(wǎng)打盡。結(jié)合針對(duì)C端肽段構(gòu)建的特征譜圖庫(kù)，DIA可實(shí)現(xiàn)jīngzhǔn識(shí)別與定量，尤其適合復(fù)雜樣本中的C端特異性檢測(cè)。

2、高分辨質(zhì)譜平臺(tái)帶來(lái)jīngzhǔn測(cè)序

如Orbitrap Exploris 480、Q Exactive HF-X等gāoduān質(zhì)譜儀具備更高分辨率、更快掃描速度和更寬動(dòng)態(tài)范圍，能清晰分辨低豐度、相似質(zhì)量的C端肽段。配合納流LC系統(tǒng)，極大提升了整體靈敏度與數(shù)據(jù)重現(xiàn)性。

四、生信算法與數(shù)據(jù)庫(kù)優(yōu)化：補(bǔ)齊識(shí)別盲區(qū)

1、自定義數(shù)據(jù)庫(kù)匹配提高準(zhǔn)確性

傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫(kù)多以全蛋白序列構(gòu)建，針對(duì)C端位點(diǎn)的識(shí)別靈敏度不足。通過(guò)引入特定“decoy”序列、模擬C端剪切形式，可提升搜索引擎對(duì)真實(shí)C端的識(shí)別能力。

2、AI算法提升譜圖識(shí)別率

隨著機(jī)器學(xué)習(xí)與深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的引入，生信平臺(tái)可對(duì)弱信號(hào)譜圖進(jìn)行智能二次打分。即便是低質(zhì)量、弱響應(yīng)的C端肽段，也可通過(guò)模型識(shí)別出潛在結(jié)構(gòu)，從而顯著降低假陰性率。

??這些策略為Cduāncèxù提供了數(shù)據(jù)層面的保障，使整個(gè)流程更智能、高效。

隨著dànbáizhì組學(xué)技術(shù)的不斷演進(jìn)，Cduāncèxù正逐步從“小眾難題”邁向“大規(guī)模應(yīng)用”。通過(guò)整合化學(xué)富集策略、優(yōu)良質(zhì)譜平臺(tái)與智能算法支持，研究者得以實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白C端的高靈敏、高通量解析。百泰派克生物科技構(gòu)建了標(biāo)準(zhǔn)化、高通量的Cduāncèxù平臺(tái)，已服務(wù)于多家科研院所與生物醫(yī)藥企業(yè)，為蛋白功能研究與藥物開(kāi)發(fā)提供有力支持。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

高效C端測(cè)序策略：提升準(zhǔn)確性與靈敏度檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹