抗體藥物開發(fā)指南：全長測序能解決CDR區(qū)識別中的哪些難題？檢測技術(shù)服務詳情介紹

在抗體藥物研發(fā)中，CDR（互補決定區(qū)）序列的jīngzhǔn識別至關(guān)重要。CDR決定了抗體的抗原特異性，是親和力工程、候選篩選與zhuānlì布局的關(guān)鍵依據(jù)。然而，由于CDR序列本身的多樣性和結(jié)構(gòu)復雜性，其準確解析長期面臨技術(shù)瓶頸。

隨著質(zhì)譜技術(shù)和序列重建算法的不斷進步，基于dànbáizhì水平的全長抗體測序技術(shù)，正成為突破CDR識別難題的手段，為抗體開發(fā)提供更高分辨率的結(jié)構(gòu)信息。

一、為什么CDR區(qū)識別如此關(guān)鍵？

抗體的可變區(qū)由三個CDR區(qū)（CDR1、CDR2、CDR3）和四個框架區(qū)（FR）組成。其中，CDR3因其高度多樣性，zuì能決定抗體的結(jié)合特異性，也是zuì難準確解析的區(qū)域。CDR識別對于以下環(huán)節(jié)至關(guān)重要：

• 抗體親和力改造：CDR結(jié)構(gòu)決定抗原結(jié)合位點的構(gòu)象。

• 候選抗體篩選與比對：需高保真度地識別CDR序列差異。

• 知識產(chǎn)權(quán)保護：CDR序列常作為抗體zhuānlì的核心內(nèi)容。

• 免疫原性評估：需識別潛在的T細胞表位，多集中于CDR區(qū)。

二、傳統(tǒng)CDR識別方法的局限性

過去，CDR識別多依賴于基因工程構(gòu)建的抗體文庫，通過Sanger測序或PCR擴增獲得VH/VL序列。這些方法存在顯著短板：

• 模板依賴：需已知抗體基因信息或表達載體序列。

• 信息缺失：難以覆蓋抗體修飾區(qū)、序列突變或拼接異構(gòu)體。

• 無法反映真實蛋白產(chǎn)物：核酸序列不能還原翻譯后修飾（PTMs）。

尤其對于來自雜交瘤或動物血清的天然抗體樣本，缺乏模板信息的情況下，傳統(tǒng)方法難以實現(xiàn)CDR的完整解析與jīngzhǔn定位。

三、抗體全長測序如何破解CDR識別難題？

基于質(zhì)譜和高通量測序技術(shù)的全長抗體測序（Top-Down / Bottom-Up + De Novo Assembly），可以從dànbáizhì水平直接讀取完整抗體鏈的氨基酸序列，具有以下優(yōu)勢：

1、從真實產(chǎn)物出發(fā)，避免模板依賴

通過質(zhì)譜對純化后的抗體蛋白直接進行裂解、酶解與片段分析，不依賴DNA模板，即便是來源未知的雜交瘤或臨床樣本，也能jīngzhǔn解析。

2、高精度解析CDR區(qū)

通過搭配多種酶（Trypsin, Chymotrypsin, Lys-C等）產(chǎn)生重疊肽段，并結(jié)合De Novo算法重建序列，CDR1~3的區(qū)域覆蓋率顯著提高。在復雜背景下，仍能實現(xiàn)多肽拼接并準確定位CDR區(qū)。

3、識別翻譯后修飾與序列變異

全長測序可檢測如半guāngānsuān異構(gòu)、糖基化、異源輕鏈拼接等修飾，有助于識別非典型CDR區(qū)變化，增強對功能結(jié)構(gòu)的解析能力。

4、抗體同源異構(gòu)體分辨能力強

對于有多個相似抗體的表達體系（如多克隆抗體、雙特異抗體），高分辨率的質(zhì)譜策略可解析不同CDR組合，支持抗體庫篩選和優(yōu)化。

四、百泰派克生物科技：加速您的抗體藥物開發(fā)進程

在百泰派克生物科技，我們集成高分辨率Orbitrap-MS系統(tǒng)與多酶裂解策略，結(jié)合自研的序列拼接算法，可實現(xiàn)：

• 全長IgG抗體的序列還原（>95%覆蓋率）

• jīngquè解析VH/VL鏈與CDR1-3區(qū)域

• 識別低豐度突變與罕見修飾

• 提供適用于IND申報的抗體序列報告

結(jié)語：更快、更準、更可靠的CDR識別之路

抗體藥物的成功開發(fā)，始于對其分子本質(zhì)的jīngzhǔn認知。全長抗體測序技術(shù)，尤其在CDR識別方面展現(xiàn)出qiánsuǒwèiyǒu的解析力和通用性。通過質(zhì)譜級別的數(shù)據(jù)支持，研究者不僅可以獲取全面、可信的抗體序列信息，更能為親和力優(yōu)化、臨床轉(zhuǎn)化與zhuānlì保護打下堅實基礎。如果您正面臨抗體結(jié)構(gòu)解析或CDR區(qū)確認的挑戰(zhàn)，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，我們將以zhuānyè、快速、可靠的測序方案，助您一臂之力。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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