蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略
2025-08-11
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蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹
在真核細(xì)胞中,dànbáizhì的結(jié)構(gòu)和功能不僅由其氨基酸序列決定,更受到翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)的深遠(yuǎn)影響。PTMs 是指dànbáizhì在翻譯完成后通過酶促作用被化學(xué)修飾的過程,這一機(jī)制參與了細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞周期、免疫應(yīng)答等多種生物學(xué)過程。鑒于其在生理和病理狀態(tài)中的核心作用,dànbáizhì翻譯后修飾研究已成為蛋白組學(xué)中的關(guān)鍵領(lǐng)域。
一、常見的dànbáizhì翻譯后修飾類型
dànbáizhì可以經(jīng)歷數(shù)百種不同的翻譯后修飾,其中zuì為常見且研究zuì深入的包括:
1、磷酸化(Phosphorylation)
磷酸化是zuì常見的PTM形式之一,通常發(fā)生在sīānsuān(Ser)、sūānsuān(Thr)和làoānsuān(Tyr)殘基上。它在信號(hào)傳導(dǎo)通路中發(fā)揮核心作用,調(diào)控酶活性、dànbáizhì穩(wěn)定性和蛋白互作。
2、乙?;ˋcetylation)
乙?;瘡V泛存在于組蛋白和非組蛋白中,對(duì)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因表達(dá)調(diào)控具有重要意義。賴氨酸殘基的乙酰化可以改變dànbáizhì的正電荷,從而影響其結(jié)構(gòu)和功能。
3、泛素化(Ubiquitination)
泛素化是通過將小分子dànbáizhì“泛素”連接到目標(biāo)dànbáizhì的賴氨酸殘基上,實(shí)現(xiàn)對(duì)其降解、定位或功能調(diào)節(jié)。多泛素鏈的構(gòu)型還可決定不同的細(xì)胞命運(yùn)。
4、糖基化(Glycosylation)
糖基化是將糖類基團(tuán)共價(jià)附著到dànbáizhì上,常見于細(xì)胞膜蛋白和分泌蛋白。其不僅影響dànbáizhì折疊、穩(wěn)定性和半衰期,也與癌癥、感染等疾病密切相關(guān)。
5、甲基化(Methylation)
甲基化可發(fā)生在賴氨酸或jīngānsuān殘基上,常見于組蛋白中,調(diào)控染色質(zhì)狀態(tài)與基因沉默。同時(shí)也存在于代謝酶、轉(zhuǎn)錄因子等非組蛋白中。
二、dànbáizhì翻譯后修飾的研究策略
由于PTMs通常發(fā)生在低豐度、特異性位置且動(dòng)態(tài)變化明顯,因此對(duì)其研究需要高度靈敏和特異的技術(shù)支持。以下為目前主流的研究策略。
1、親和富集策略:提高修飾肽的檢測效率
翻譯后修飾的一個(gè)挑戰(zhàn)在于其豐度低、修飾位點(diǎn)復(fù)雜,直接質(zhì)譜檢測往往難以識(shí)別。為此,親和富集技術(shù)是研究PTMs的前提步驟。
抗體富集:針對(duì)特定修飾(如磷酸化、乙?;╅_發(fā)的單克隆或多克隆抗體可以高效識(shí)別目標(biāo)肽段,例如使用anti-phospho-Ser/Thr/Tyr抗體進(jìn)行磷酸肽富集。
金屬氧化物親和層析(MOAC)與IMAC:這兩種方法常用于磷酸肽的非抗體依賴型富集,TiO?和Fe3?離子可與磷酸基團(tuán)強(qiáng)烈結(jié)合,提高磷酸肽的回收率。
Lectin富集:適用于糖基化研究,不同凝集素可識(shí)別不同類型的糖殘基結(jié)構(gòu),如ConA、WGA等。
親和富集后的樣品可顯著提高質(zhì)譜分析中目標(biāo)修飾肽的比例,增強(qiáng)檢測靈敏度和數(shù)據(jù)質(zhì)量。
2、高分辨質(zhì)譜分析:定性與定量的核心工具
質(zhì)譜(MS)是研究PTMszuì強(qiáng)大的工具之一,尤其是Orbitrap、TOF等高分辨平臺(tái)。
數(shù)據(jù)依賴采集(DDA):通過對(duì)高強(qiáng)度離子優(yōu)先碎裂,獲取修飾肽段序列信息,適用于修飾位點(diǎn)鑒定。
數(shù)據(jù)獨(dú)立采集(DIA):全面、重復(fù)性強(qiáng),適合多樣本間修飾定量比較,常與Spectronaut、DIA-NN等軟件配合分析。
平行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)與選擇反應(yīng)監(jiān)測(SRM):用于特定修飾肽的靶向定量分析,靈敏度高、定量jīngquè。
通過MS/MS譜圖解讀,可以確定修飾類型、修飾位點(diǎn)位置及其變化趨勢。
3、定量策略:揭示PTMs的動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制
在比較不同處理?xiàng)l件(如刺激前后、突變體與野生型)下PTMs變化時(shí),定量策略尤為關(guān)鍵。
TMT/iTRAQ標(biāo)記:適用于多樣本并行定量分析,配合高通量MS平臺(tái)可實(shí)現(xiàn)數(shù)十個(gè)樣本中修飾變化的系統(tǒng)分析。
Label-free定量:對(duì)樣本處理簡便,不受標(biāo)簽限制,適合大規(guī)模探索性研究,但對(duì)質(zhì)譜平臺(tái)穩(wěn)定性要求高。
SILAC:通過代謝標(biāo)記將重同位素氨基酸摻入細(xì)胞中,適合細(xì)胞系的jīngzhǔn定量研究,尤其在泛素化等動(dòng)態(tài)變化中表現(xiàn)優(yōu)異。
4、生物信息學(xué)分析:從“點(diǎn)”到“網(wǎng)”的整合解讀
PTMs的研究不僅止于位點(diǎn)的鑒定,更需要系統(tǒng)地理解其在生物通路和功能模塊中的作用。
位點(diǎn)注釋:如使用PhosphoSitePlus、UniProt數(shù)據(jù)庫,識(shí)別已知與新發(fā)現(xiàn)的修飾位點(diǎn)。
富集分析:GO與KEGG通路富集幫助揭示修飾蛋白的功能傾向與生物學(xué)意義。
互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:結(jié)合STRING、Cytoscape等工具構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),挖掘核心調(diào)控節(jié)點(diǎn)。
修飾互作分析(Crosstalk):多個(gè)修飾類型之間可能存在協(xié)同或拮抗作用,如磷酸化-乙酰化“調(diào)控開關(guān)”的關(guān)系,是PTMs研究的前沿方向。
dànbáizhì翻譯后修飾是解析生命活動(dòng)精細(xì)調(diào)控的“密碼層”,其研究對(duì)于疾病機(jī)制揭示、藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)及生物標(biāo)志物開發(fā)具有bùkětìdài的重要意義。通過整合樣本前處理、富集技術(shù)、質(zhì)譜分析與生物信息學(xué)解讀,科研人員正不斷拓展dànbáizhì翻譯后修飾的研究。百泰派克生物科技依托深厚的蛋白組學(xué)技術(shù)積累和gāoduān質(zhì)譜平臺(tái),持續(xù)為生命科學(xué)研究提供高質(zhì)量的翻譯后修飾蛋白組分析服務(wù),助力更多科研項(xiàng)目走得更深、更遠(yuǎn)。
百泰派克生物科技特色項(xiàng)目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學(xué)
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
百泰派克生物科技七大檢測平臺(tái)
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
蛋白質(zhì)翻譯后修飾的常見研究策略檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹
北京百泰派克生物科技有限公司
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