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上新│Cas12a:CRISPR工具箱中的新星!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年05月13日 13:53  

2023年11月16日,Vertex Pharmaceuticals和CRISPR Therapeutics共同宣布基因編輯療法產(chǎn)品CASGEVY™(Exagaglogene autotemcel)獲英國藥品監(jiān)管機構MHRA有條件批準上市,用于治療治療鐮狀細胞?。⊿CD)和輸血依賴性β-地中海貧血(TDT),是獲批上市的CRISPR基因編輯藥物。

 


圖1. CASGEVY™治療流程(Source:CRISPR Therapeutics)

 

CASGEVY™療法是基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的治療方案,CRISPR/Cas9系統(tǒng)因為其簡單性和易于RNA編程的潛力,是所有CRISPR-Cas系統(tǒng)中用于基因工程開發(fā)的最佳候選系統(tǒng)。目前基于CRISPR/Cas9系統(tǒng)的基因編輯技術已經(jīng)成功應用于治療、育種、合成生物學等各個領域。

 

CRISPR基因編輯技術,除了CRISPR/Cas9體系外,CRISPR/Cas12a體系正憑借其優(yōu)勢逐漸嶄露頭角。與CRISPR/Cas9體系相比,CRISPR/Cas12a體系在核酸酶結構域、向?qū)NA(gRNA)以及產(chǎn)生的DNA末端類型等方面都有著顯著的差異,詳見下表

圖2. Cas9系統(tǒng)與Cas12系統(tǒng)對比[1]

 

除以上差異外,Cas12a在切割活性方面也與Cas9存在顯著區(qū)別。Cas9僅具有順式切割活性,用于DNA雙鏈斷裂。而Cas12a不僅具有順式切割活性,還具備的反式切割活性,這使得它在基因編輯領域展現(xiàn)出更為廣泛的應用潛力。

 

 

 

CRISPR/Cas12a切割活性

 
 
01
 

順式切割活性

Cas12a由單個crRNA引導,當形成crRNA-Cas12a復合物時,它的構象會發(fā)生變化。然后,該復合物識別DNA非靶標鏈中特定的PAM位點。在距離PAM位點8個核苷酸(nt)的位置,RuVC結構域切割DNA靶標鏈,產(chǎn)生5’端的粘性突出末端。

02
 

反式切割活性

Cas12a能夠特異性地識別并切割雙鏈DNA(dsDNA),隨后釋放單鏈脫氧核糖核酸酶(ssDNase)活性。這種活性使得Cas12a能夠無差別地裂解附近的單鏈DNA(ssDNA)。因此,Cas12a系統(tǒng)可以與LAMP等核酸檢測技術相結合,為核酸檢測、病原體識別等領域提供高效、靈敏且便捷的工具,展現(xiàn)出巨大的應用前景。

 

圖3. Cas12a順式及反式切割活性[2]

 

基于CRISPR/Cas12a廣泛的應用場景,翌圣鎂孚泰生物ZymeEditor(點擊了解更多)酶改造及發(fā)酵純化工藝平臺新開發(fā)了來源于細菌Agathobacter rectalisArCas12a,與其它Cas12a(LbCas12a/AsCas12a)相比,其具有更高的溫度適應性(25-55℃),非常適用于基因組編輯及核酸檢測等應用場景。

 

 

 

ArCas12a性能展示

 
01

dsDNA高效體外切割

以dsDNA模板為靶標,加入ArCas12a、crRNA(存在與模板DNA序列互補的spacer區(qū))進行體外切割,瓊脂糖凝膠電泳檢測切割效果。結果顯示翌圣的ArCas12a在crRNA的引導下可高效的切割dsDNA(600 bp)產(chǎn)生兩段切割產(chǎn)物(200 bp+400 bp)。

 

圖4. ArCas12a順式切割活性檢測 M:Marker;C:模板dsDNA

 

02

反式切割活性強,可用于核酸檢測

以dsDNA模板為靶標,加入ArCas12a、crRNA(存在與模板DNA序列互補的spacer區(qū))及單鏈DNA報告探針(含有熒光報告集團)進行體外切割,當ArCas12a與crRNA及靶標DNA形成復合體后會激活反式切割活性,切割單鏈DNA報告探針,從而發(fā)出熒光。結果顯示,翌圣ArCas12a與crRNA及模板DNA形成復合體后具有反式切割活性,可剪切單鏈DNA。

 

圖5. ArCas12a反式切割活性檢測

 

03

無核酸外切酶殘留

將底物DNA與10 pmol ArCas12a共同孵育,瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果顯示翌圣的ArCas12a無核酸外切酶殘留。

 

圖6. ArCas12a核酸外切酶殘留檢測 C:陰性對照

 

04

無RNase殘留

將底物RNA與5 pmol ArCas12a共同孵育,瓊脂糖凝膠電泳檢測,結果顯示翌圣的ArCas12a無RNase殘留。

 

圖7. ArCas12a RNase酶殘留檢測 C:陰性對照

 

 

 

產(chǎn)品推薦

 

產(chǎn)品分類

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號

Cas12a

ArCas12a Nuclease

14702ES

Lbcpf1 (Cas12) Nuclease

11354ES

Fncpf1(Cas12) Nuclease

11353ES

Ascpf1(Cas12) Nuclease

11352ES

Cas12b

AapCas12b Nuclease

14808ES

Cas9

Cas9 Nuclease

14701ES

NLS-Cas9-EGFP Nuclease

11364ES

sgRNA合成

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit

11355ES



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