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上新 | T4核酸內(nèi)切酶V:高效DNA損傷修復(fù)!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2024年08月13日 10:17  

T4核酸內(nèi)切酶V(T4 Endonuclease V),也被稱為T4 PDG(嘧啶二聚體糖基酶),是一種具有雙重活性的DNA 糖基化酶,結(jié)合了DNA N-糖基化酶和AP裂解酶活性。它可識(shí)別并結(jié)合因紫外線照射形成的cis-syn型環(huán)丁烷嘧啶二聚體,在嘧啶二聚體的5’端切割糖苷鍵,從而釋放出二聚體并留下一個(gè)AP位點(diǎn),隨后AP裂解酶活性通過 β 消除切割 AP 位點(diǎn),與 3'-α、β-不飽和醛和5'-磷酸末端形成1個(gè)核苷酸DNA間隙(圖1)

 


圖1. T4 Endonuclease V反應(yīng)原理示意圖[1]

 

T4 Endonuclease V可用于:

1、彗星實(shí)驗(yàn)(單細(xì)胞凝膠電泳)中增強(qiáng)對(duì)特定類型的DNA損傷,使損傷明顯檢測(cè);

2、檢測(cè)和定量DNA損傷(比如RADAR-seq技術(shù) [2],引入一段含有能被測(cè)序檢測(cè)的甲基化堿基序列作為標(biāo)記,以實(shí)現(xiàn)對(duì)損傷位點(diǎn)的檢測(cè)、定位和定量);

3、FFPE樣本修復(fù)中識(shí)別并切割含有氧化損傷堿基的DNA鏈以啟動(dòng)DNA修復(fù)。

 

翌圣T4 Endonuclease V產(chǎn)品數(shù)據(jù)展示

翌圣酶研發(fā)團(tuán)隊(duì)潛心研發(fā),成功推出市售T4 Endonuclease V(Cat#14542ES)。翌圣T4 Endonuclease V來源于T4 噬菌體,蛋白純度≥95%(SDS-PAGE法),不含非特異性DNA酶殘留,大腸桿菌宿主gDNA殘留<0.05 copies/1U。

 

01
不含特異性DNase殘留

20 μL反應(yīng)體系中,加入3個(gè)批次的3 U T4 Endonuclease V和 0.5 μg λDNA-HindⅢ digest,37℃孵育16 h,瓊脂糖凝膠電泳DNA譜帶不發(fā)生變化,表明翌圣Endonuclease IV不含非特異性DNase殘留。

 

圖2. 非特異性DNase殘留檢測(cè)

 

02
宿主(E.coli)gDNA殘留<0.05 copies/1U

對(duì)3個(gè)批次的翌圣T4 Endonuclease V進(jìn)行宿主(E.coli)基因組DNA殘留檢測(cè),結(jié)果顯示翌圣Endonuclease IV的宿主gDNA殘留<0.05 copies/1 U。

 

圖3. 宿主gDNA殘留

 

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產(chǎn)品定位

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號(hào)

DNA損傷修復(fù)酶

Endonuclease IV

14543ES

T4 Endonuclease V

14542ES

Endonuclease VIII

14536ES

 

參考文獻(xiàn):

[1] Cafardi JA, Elmets CA. T4 endonuclease V: review and application to dermatology. Expert Opin Biol Ther. 2008 Jun;8(6):829-38. doi: 10.1517/14712598.8.6.829. PMID: 18476794.

[2] Selvam K, Sivapragasam S, Poon GMK, Wyrick JJ. Detecting recurrent passenger mutations in melanoma by targeted UV damage sequencing. Nat Commun. 2023 May 11;14(1):2702. doi: 10.1038/s41467-023-38265-3. PMID: 37169747; PMCID: PMC10175485.

 



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