來自Universidade Católica de Brasília(UCB)的Octávio L. Franco、Universidade Católica Dom Bosco的Marlon H. Cardoso等人系統(tǒng)綜述了抗菌肽(AMPs)的結(jié)構多樣性、作用機制及耐藥應對策略,并強調(diào)其在人類、動物健康及農(nóng)業(yè)中的廣闊應用前景。盡管面臨毒性與穩(wěn)定性挑戰(zhàn),通過AI輔助設計、結(jié)構優(yōu)化與多靶點策略,AMPs有望成為對抗耐藥病原體的下一代關鍵抗菌劑。
基于該篇綜述,《Nature Reviews Microbiology》也一舉成為Nature系列漲幅最大的期刊,從69.2一下子增長34.1達到了103.3,一躍成為該系列中影響因子最高的期刊。
研究背景
隨著抗生素抗性在人類和動物病原體中的迅速發(fā)展,迫切需要新的解決方案來對抗這一問題??咕模?/span>AMPs)作為一種有前景的治療分子,因其特殊的結(jié)構和針對病原微生物的不同分子靶點而備受關注。本文綜述了AMPs的多面性結(jié)構特征、先進的結(jié)構構象、不同的作用機制以及新的靶點。此外,還討論了抗性機制、交叉抗性以及AMP設計和優(yōu)化的創(chuàng)新策略。文章強調(diào),深入了解AMPs的結(jié)構安排、靶點和設計優(yōu)化對于開發(fā)能夠轉(zhuǎn)化為臨床及其他廣泛應用的創(chuàng)新療法至關重要。
抗菌肽的作用機制
抗菌肽(AMPs):AMPs是一類具有直接抗菌活性的分子,廣泛存在于真核生物、細菌和古菌中,通過不同的作用機制對抗多種微生物,包括革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、真菌和病毒。AMPs通過破壞細菌膜的完整性來殺死病原體,其作用機制包括形成孔道、改變膜的通透性等。 AMPs還可以靶向細胞內(nèi)過程,如蛋白質(zhì)合成、DNA和RNA復制以及細胞壁生物合成,展現(xiàn)出多樣化的抗菌機制。
在動物中,宿主防御肽(如LL-37)通過調(diào)節(jié)TLR4介導的免疫信號、招募免疫細胞和調(diào)控炎癥反應來抵御感染;在植物中,AMP通過PRR識別病原體分子模式(如flg22、chitin),激活MAPK通路誘導防御基因表達、激素積累(SA、JA)及細胞壁強化;在共生體系中,根瘤中的NCR肽可促進根瘤菌終末分化以增強固氮效率;而在農(nóng)業(yè)環(huán)境中,AMP的可降解性減少了對環(huán)境微生物組的選擇壓力,優(yōu)于傳統(tǒng)抗生素。
2.抗菌肽的結(jié)構優(yōu)勢
AMPs具有多樣性: AMPs具有多種結(jié)構構象,包括線性延伸、α-螺旋、β-折疊和混合α-β結(jié)構。近年來,環(huán)狀或復雜肽拓撲結(jié)構也被發(fā)現(xiàn),這些結(jié)構增加了AMPs的穩(wěn)定性和抗菌活性。并且細菌可以通過改變膜電荷、形成生物膜、分泌外膜囊泡等方式抵抗AMPs。一些AMPs(如多粘菌素)已顯示出對某些耐藥菌株的有效性,但其臨床應用受限于毒性和穩(wěn)定性問題。
3. 抗菌肽的未來前景
AMPs的設計與優(yōu)化:AMPs可以通過計算工具(如進化遺傳算法、機器學習)和結(jié)構修飾(如環(huán)化、N-封端、D-氨基酸摻入)可以優(yōu)化AMPs的抗菌活性和穩(wěn)定性。AMPs同時可以結(jié)合自組裝納米結(jié)構(如納米纖維、納米顆粒),結(jié)合上述開發(fā)為提高AMPs的體內(nèi)半衰期和局部濃度提供了新途徑。
抗菌肽的臨床應用: AMPs在臨床試驗中顯示出治療多種感染的潛力,但其系統(tǒng)性應用仍面臨挑戰(zhàn),如毒性、酶降解和口服生物利用度低。與此同時:AMPs在動物健康領域也顯示出良好的應用前景,如在畜禽生產(chǎn)中作為抗生素替代品。
總結(jié)
抗菌肽(AMPs)作為一類新型抗菌分子,不僅具有多樣化的結(jié)構和作用機制,還能夠克服傳統(tǒng)抗生素的抗性挑戰(zhàn)。其生物相容性和環(huán)境友好性使其在農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)中具有廣闊的應用前景。隨著設計和優(yōu)化技術的不斷進步,AMPs有望成為抗生素類藥物更新?lián)Q代的重要選擇,為應對全球抗生素抗性危機提供新的解決方案,或許成為下一代抗生素類藥物的版本答案!
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