生物試劑研究人胚胎早期器官形成過程的轉(zhuǎn)錄組研究新進(jìn)展

    著床后人胚胎發(fā)育涵蓋了胚胎早期器官形成zui關(guān)鍵時(shí)期，即從Carnegie Stage 9（胚胎發(fā)育第20天，E20）到Carnegie Stage 14（胚胎發(fā)育第32天，E32）。從發(fā)育形態(tài)變化角度，各個(gè)器官經(jīng)歷了從無到有的奇妙過程；從發(fā)育進(jìn)化角度，這個(gè)奇妙過程高度保守；從發(fā)育潛能角度，干性潛能與分化潛能既定時(shí)空程序協(xié)調(diào)性變化。這些背后的分子基礎(chǔ)是遺傳信息表達(dá)精密調(diào)控的基因相互作用網(wǎng)絡(luò)。然而，相比模式生物與體外細(xì)胞模型研究，由于受限于人胚胎研究標(biāo)本以及倫理上的限制，關(guān)于人胚胎發(fā)育的分子機(jī)制知之甚少。

    楊穎博士和方海博士等在金穎和張濟(jì)導(dǎo)師的指導(dǎo)下，與新華醫(yī)院婦產(chǎn)科合作，利用臨床藥物流產(chǎn)胚胎，應(yīng)用基因芯片對該早期器官胚胎發(fā)育6個(gè)連續(xù)階段進(jìn)行基因表達(dá)變化譜刻畫。通過數(shù)據(jù)深層次挖掘并整合功能、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、表型及疾病相關(guān)的數(shù)據(jù)庫，他們發(fā)現(xiàn)整個(gè)胚胎形態(tài)變化受基因表達(dá)譜變化所驅(qū)使，主要包括兩組基因：呈現(xiàn)逐漸下調(diào)變化趨勢的基因負(fù)責(zé)早期器官起始，而逐漸上調(diào)變化的基因主要參與器官原基形成。同小鼠發(fā)育表達(dá)譜以及人胚胎干細(xì)胞各種組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較分析，進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)干性相關(guān)基因呈逐漸降低的趨勢，而分化相關(guān)基因呈現(xiàn)兩種表達(dá)模式。 在此基礎(chǔ)上，整合蛋白質(zhì)相互作用信息，挖掘人胚胎早期器官過程中相互作用網(wǎng)絡(luò)（hORGNet），由兩個(gè)細(xì)化的與干性相關(guān)的模塊（hStemModule）和與分化相關(guān)的模塊（hDiffModule）模塊組成，分別表征干性潛能狀態(tài)變化情況與分化狀態(tài)。進(jìn)一步通過小鼠表型富集分析，hStemModule可能與胚胎早期致死相關(guān)，而hDiffModule則可能多的是與出生后致死相關(guān)。這一研究建立了上*的人早期器官形成期基因表達(dá)的譜式，為探索人類發(fā)育早期的分子調(diào)控和人多能干細(xì)胞體外的定向誘導(dǎo)分化提供的寶貴的信息。

340-90-9    [4-(2-naphthyl)phenyl]boronic acid    4-chloropyridine    
340-05-6    918799-14-1    626-64-2    
340-05-6    3-溴-4,5,6-*氧基-2-甲基苯...    4-羥基吡啶    
339-59-3    3-bromo-4,5,6-trimethoxy-2-methylphenol    4-Pyridinol    
339-59-3    918879-58-0    626-67-5    
338-98-7    H2ATSM/A    N-甲基哌啶    
338-98-7    H2ATSM/A    N-Methylpiperidine    
338-95-4    919346-89-7    626-72-2    
338-95-4    5-溴異二氫吲哚鹽酸鹽    L-高胱氨酸    
338-84-1    5-Bromo-2,3-dihydro-1H-Isoindole Hydrochloride    4,4'-dithiobis[2-aminobutyric] acid    
338-84-1    919347-69-6    626-82-4    
338-83-0    5-醛基吡啶-3-硼酸    己酸丁酯    
338-83-0    5-formylpyridin-3-ylboronic acid    butyl caproate    
338-76-1    919475-15-3    626-86-8    
338-76-1    2-[4-(芐氧基)苯基]-N,N-二甲...    己二酸單乙酯    
338-69-2    Benzeneacetamide, N,N-dimethyl-4-(phenylmethoxy)-    Adipic acid monoethyl ester    
338-69-2    920979-04-0    626-87-9    
338-38-5    2-氟-3-碘-6-甲基吡啶    1,4-二溴戊烷    
338-38-5    2-fluoro-3-iodo-6-methylpyridine    1,4-Dibromopentane    
336-59-4    921205-03-0    626-88-0    
336-59-4    3,3'-[5'-[3-(3-吡啶基)苯基][...    1-溴-4-甲基戊烷    
335-76-2    3,3'-[5'-[3-(3-Pyridinyl)phenyl][1,1':3',1''-terphenyl]-3,3'...    1-bromo-4-methylpentane    
335-76-2    921630-14-0    626-89-1    
335-67-1    2-溴-5-氯吡啶-4-甲醛    4-甲基-1-戊醇    
335-67-1    2-Bromo-5-chloropyridine-4-carboxaldehyde    4-Methyl-1-pentanol    
335-64-8    923009-50-1    626-93-7    
335-64-8    1-氧代-2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷...    2-己醇    
335-57-9    tert-butyl 2-ethyl-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxy...    2-Hexanol    
335-57-9    923009-50-1    626-97-1    
335-56-8    2,7-二氮雜螺[4.5]癸烷-1-酮    戊酰胺    
335-56-8    tert-butyl 1-oxo-2,7-diazaspiro[4.5]decane-7-carboxylate    valeramide    
334-88-3    923032-59-1    627-00-9    
334-88-3    1-烯丙基環(huán)丙磺酰氯    4-氯丁酸    
334-64-5    1-Allylcyclopropane-1-sulfonyl chloride    4-chlorobutyric acid    
334-64-5    923036-30-0    627-03-2    
334-63-4    N-甲基-N-((3R,4R)-4-甲基-1-...    乙氧基乙酸