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初級(jí)會(huì)員 | 第13年
四大因素,從源頭解析Duplication2020/06/12
四大因素,從源頭解析Duplication導(dǎo)語:測序技術(shù)面世至今發(fā)生了諸多的技術(shù)革新,經(jīng)歷了sanger測序?yàn)榇淼牡凇鷾y序、高通量為代表的第二代測序和單分子實(shí)時(shí)測序?yàn)榇淼牡谌鷾y序。迄今為止,高通量測序(nextgenerationsequencingNGS)技術(shù)日趨成熟,正式進(jìn)入臨床疾病診療階段,與我們生活息息相關(guān)。Dup背景解讀高通量測序檢驗(yàn)流程可分為“實(shí)驗(yàn)室操作”(又稱為“濕實(shí)驗(yàn)”)和“生物信息學(xué)分析”(又稱“干實(shí)驗(yàn)”)兩部分。對(duì)應(yīng)的實(shí)驗(yàn)操作部分,可點(diǎn)擊高通量建庫了解。生物信息學(xué)主要
四大因素,從源頭解析Dup2020/06/12
四大因素,從源頭解析Duplication導(dǎo)語:測序技術(shù)面世至今發(fā)生了諸多的技術(shù)革新,經(jīng)歷了sanger測序?yàn)榇淼牡凇鷾y序、高通量為代表的第二代測序和單分子實(shí)時(shí)測序?yàn)榇淼牡谌鷾y序。迄今為止,高通量測序(nextgenerationsequencingNGS)技術(shù)日趨成熟,正式進(jìn)入臨床疾病診療階段,與我們生活息息相關(guān)。Dup背景解讀高通量測序檢驗(yàn)流程可分為“實(shí)驗(yàn)室操作”(又稱為“濕實(shí)驗(yàn)”)和“生物信息學(xué)分析”(又稱“干實(shí)驗(yàn)”)兩部分。對(duì)應(yīng)的實(shí)驗(yàn)操作部分,可點(diǎn)擊高通量建庫了解。生物信息學(xué)主要
探秘細(xì)胞凋亡過程2020/06/05
探秘細(xì)胞凋亡過程——實(shí)用檢測方法盤點(diǎn)背景圖1:細(xì)胞凋亡與壞死過程細(xì)胞壞死(necrosis)是因?yàn)椴±矶a(chǎn)生的被動(dòng)死亡,如物理性或化學(xué)性的損害因子及缺氧與營養(yǎng)不良等均導(dǎo)致細(xì)胞壞死。表現(xiàn)為細(xì)胞脹大、胞膜破裂、細(xì)胞內(nèi)容物外溢、核變化較慢、DNA降解不充分和引起嚴(yán)重的局部炎癥反應(yīng)等。細(xì)胞凋亡與細(xì)胞壞死不同,細(xì)胞凋亡(Apoptosis)一般是指機(jī)體細(xì)胞在發(fā)育過程中或在某些因素作用下通過細(xì)胞內(nèi)基因及其產(chǎn)物的調(diào)控而發(fā)生的一種程序性細(xì)胞死亡過程,細(xì)胞壞死是細(xì)胞受到強(qiáng)烈理化或生物因素作用引起細(xì)胞無序變化的死亡
探秘細(xì)胞凋亡的過程2020/06/05
探秘細(xì)胞凋亡過程——實(shí)用檢測方法盤點(diǎn)背景圖1:細(xì)胞凋亡與壞死過程細(xì)胞壞死(necrosis)是因?yàn)椴±矶a(chǎn)生的被動(dòng)死亡,如物理性或化學(xué)性的損害因子及缺氧與營養(yǎng)不良等均導(dǎo)致細(xì)胞壞死。表現(xiàn)為細(xì)胞脹大、胞膜破裂、細(xì)胞內(nèi)容物外溢、核變化較慢、DNA降解不充分和引起嚴(yán)重的局部炎癥反應(yīng)等。細(xì)胞凋亡與細(xì)胞壞死不同,細(xì)胞凋亡(Apoptosis)一般是指機(jī)體細(xì)胞在發(fā)育過程中或在某些因素作用下通過細(xì)胞內(nèi)基因及其產(chǎn)物的調(diào)控而發(fā)生的一種程序性細(xì)胞死亡過程,細(xì)胞壞死是細(xì)胞受到強(qiáng)烈理化或生物因素作用引起細(xì)胞無序變化的死亡
膠原酶2020/06/05
膠原酶——?jiǎng)游锝M織消化利器圖1:膠原酶產(chǎn)品介紹膠原酶(Collagenase)是一類能夠特異性的識(shí)別Pro-X-Gly-Pro序列(該序列高頻率出現(xiàn)在膠原中,很少發(fā)現(xiàn)于其他蛋白中),并切割該序列中的中性氨基酸(X)和甘氨酸(Gly)之間的肽鍵的肽鏈內(nèi)切酶,且能夠水解結(jié)締組織中的膠原蛋白。許多蛋白酶都能水解單鏈和變性的膠原多肽,但膠原酶是唯——種可以降解具有三股超螺旋結(jié)構(gòu)的天然膠原纖維的蛋白酶,其廣泛存在結(jié)締組織內(nèi),其中有效的膠原酶是由厭氧細(xì)菌溶組織梭菌(Clostridiumhistolytic
NGS在病原微生物檢測中應(yīng)用2020/06/05
NGS在病原微生物檢測中的應(yīng)用背景相關(guān)由病原微生物引起的感染性疾病是臨床面臨的常見的疾病之一,并且隨著人群結(jié)構(gòu)變化、環(huán)境污染以及藥物濫用等因素的影響,病原體呈現(xiàn)多樣化和復(fù)雜化的趨勢,逐步威脅人類健康。隨著測序技術(shù)的飛速發(fā)展,NGS已逐步應(yīng)用于感染性疾病的診斷、治療和監(jiān)測,在病原微生物鑒定、分型、耐藥突變檢測及新型病原體鑒定方面有其*的優(yōu)勢。病原微生物檢測現(xiàn)狀快速準(zhǔn)確的診斷可以對(duì)病情進(jìn)行監(jiān)控,提供有效治療,控制疾病的蔓延。目前常用的病原微生物分子檢測方法主要有:PCR技術(shù)(包括常規(guī)PCR以及qPC
NGS在腫瘤檢測中的那些事兒2020/06/05
NGS在腫瘤檢測中的那些事兒一、背景介紹20世紀(jì)以來,癌癥已成為困擾人類健康的主要危害之一。根據(jù)2019年國家癌癥中心發(fā)布的2015年全國//////新癌癥統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),2015年惡性腫瘤發(fā)病約392.9萬人,死亡約233.8萬人。平均每天超1萬人被確診為癌癥,每分鐘7.5個(gè)人確診癌癥。癌癥負(fù)擔(dān)呈持續(xù)上升態(tài)勢,近10多年來,惡性腫瘤發(fā)病率每年保持約3.9%的增幅,死亡率每年保持2.5%的增幅。因而腫瘤基因突變檢測對(duì)指導(dǎo)腫瘤靶向治療、耐藥監(jiān)測及預(yù)后判斷有重要意義。圖1:中國2015年惡性腫瘤發(fā)病與死亡
干貨分享|磁珠常見問題與解決方案2020/06/02
干貨分享|磁珠常見問題與解決方案高通量測序技術(shù)的跨越式發(fā)展,使測序能力大幅上升。在整個(gè)NGS工作流程中,磁珠是*的產(chǎn)品。磁珠通過磁顆粒活性基團(tuán)在一定條件下可與核酸結(jié)合和解離的原理,將樣本中目的片段分離??蓪?shí)現(xiàn)對(duì)核酸樣本的高通量自動(dòng)化操作,廣泛應(yīng)用于基因測序以及分子診斷領(lǐng)域??雌饋砗芎唵蔚募兓?分選實(shí)驗(yàn),卻在實(shí)際實(shí)驗(yàn)中有各種意外的情況。那關(guān)于磁珠產(chǎn)品選擇和產(chǎn)品使用方面有什么需要注意的事項(xiàng)呢?接下來小翊將從磁珠的外觀、儲(chǔ)存、應(yīng)用和使用效果逐一對(duì)癥分析,希望能幫助大家了解磁珠實(shí)驗(yàn)中的那些事。磁珠外觀Q
D-熒光素2020/05/28
D-熒光素原理D-熒光素(D-Luciferin)是熒光素酶(Luciferase)的常用底物,普遍應(yīng)用于整個(gè)生物技術(shù)領(lǐng)域,尤其是體內(nèi)活體成像技術(shù)。其作用機(jī)制是在ATP和熒光素酶的作用下,熒光素(底物)能夠被氧化發(fā)光。當(dāng)熒光素過量時(shí),產(chǎn)生的光量子數(shù)與熒光素酶的濃度呈正相關(guān)性(見下圖)。將攜帶熒光素酶編碼基因(Luc)的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染入細(xì)胞后,導(dǎo)入研究動(dòng)物如大、小鼠體內(nèi),之后注入熒光素,通過生物發(fā)光成像技術(shù)(BLI)來檢測光強(qiáng)度變化,從而實(shí)時(shí)監(jiān)測疾病發(fā)展?fàn)顟B(tài)或藥物的治療功效等。也可以利用ATP對(duì)此反應(yīng)體
轉(zhuǎn)鐵蛋白(Transferrin)2020/05/26
轉(zhuǎn)鐵蛋白(Transferrin)------無血清細(xì)胞培養(yǎng)添加物背景介紹轉(zhuǎn)鐵蛋白又名運(yùn)鐵蛋白(Transferrin,TRF、Tf),負(fù)責(zé)運(yùn)載由消化管吸收的鐵和由紅細(xì)胞降解釋放的鐵。以三價(jià)鐵復(fù)合物(Tf-Fe3+)的形式進(jìn)入骨髓中,供成熟紅細(xì)胞的生成。轉(zhuǎn)鐵蛋白主要存在于血漿中,血漿中的轉(zhuǎn)鐵蛋白供應(yīng)機(jī)體絕大部分組織的鐵,而在其不能到達(dá)的部位,由這些組織自己合成的轉(zhuǎn)鐵蛋白在局部產(chǎn)生轉(zhuǎn)鐵作用。圖1:轉(zhuǎn)鐵蛋白的結(jié)構(gòu)人轉(zhuǎn)鐵蛋白(HumanTransferrin)主要在肝臟合成,是由位于同源N-端和C-端
免疫球蛋白G(IgG)2020/05/26
免疫球蛋白G(IgG)——模擬抗體活性,神似抗體結(jié)構(gòu)免疫球蛋白免疫球蛋白(Ig)指具有抗體(Ab)活性或化學(xué)結(jié)構(gòu),與抗體分子相似的球蛋白。免疫球蛋白是由兩條相同的輕鏈和兩條相同的重鏈通過鏈間二硫鍵連接而成的四肽鏈結(jié)構(gòu)。免疫球蛋白分為五類,即免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白D(IgD)和免疫球蛋白E(IgE)。圖1五類免疫球蛋白結(jié)構(gòu)示意圖IgG簡介免疫球蛋白G(ImmunoglobulinG,IgG)是血清中免疫球蛋白主成分,約占血清中免疫球蛋白總
免疫球蛋白G2020/05/26
免疫球蛋白G(IgG)——模擬抗體活性,神似抗體結(jié)構(gòu)免疫球蛋白免疫球蛋白(Ig)指具有抗體(Ab)活性或化學(xué)結(jié)構(gòu),與抗體分子相似的球蛋白。免疫球蛋白是由兩條相同的輕鏈和兩條相同的重鏈通過鏈間二硫鍵連接而成的四肽鏈結(jié)構(gòu)。免疫球蛋白分為五類,即免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白M(IgM)、免疫球蛋白D(IgD)和免疫球蛋白E(IgE)。圖1五類免疫球蛋白結(jié)構(gòu)示意圖IgG簡介免疫球蛋白G(ImmunoglobulinG,IgG)是血清中免疫球蛋白主成分,約占血清中免疫球蛋白總
【干貨】qPCR常見問題及解決方案2020/05/26
qPCR常見問題及解決方案對(duì)于從事分子生物學(xué)研究的實(shí)驗(yàn)猿來說,RT-qPCR實(shí)驗(yàn)可謂是老生常談了??此骑L(fēng)平浪靜,只需“RNA提取-反轉(zhuǎn)錄-熒光定量”這些按部就班的操作,實(shí)則險(xiǎn)象環(huán)生,一丁點(diǎn)的出錯(cuò)都有可能讓我們懷疑人生。即便如此,在CNS的召喚下我們?nèi)耘f一遍遍的重復(fù)、重復(fù)、再重復(fù)。小翊深有體會(huì),為此嘔心瀝血整理出來常用的SYBRGreen染料法RT-qPCR實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)常見問題,并給出了可能的原因和解決方案,希望大家能夠順利度過RT-qPCR大關(guān)。RT-qPCR實(shí)驗(yàn)中,大家或多或少會(huì)遇到擴(kuò)增曲線異常
Hifair Ⅲ 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR (gDNA digester plus)2020/05/21
Hifair®Ⅲ1stStrandcDNASynthesisSuperMixforqPCR(gDNAdigesterplus)——Yeasen第三代逆轉(zhuǎn)錄酶預(yù)混液,高質(zhì)量cDNA的*!研發(fā)背景RT-qPCR是一個(gè)多步驟連貫實(shí)驗(yàn),逆轉(zhuǎn)錄的實(shí)驗(yàn)結(jié)果只能通過后續(xù)qPCR進(jìn)行判定,因此這一過程的成功與否十分關(guān)鍵。實(shí)驗(yàn)過程中,你是否有遇到過這些問題?1.逆轉(zhuǎn)錄效率低導(dǎo)致后續(xù)qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果Ct值偏大?2.RNA具有復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)或GC含量高導(dǎo)致逆轉(zhuǎn)錄失敗?3.逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)品組分多,加樣麻煩誤差還大?。。。。。。
搞事情,翊圣請(qǐng)來了四位ECL超級(jí)魔術(shù)師?2020/05/20
搞事情啊,翊圣請(qǐng)來了四位ECL超級(jí)魔術(shù)師??老板,都說你家ECL功能強(qiáng),我給個(gè)飛克級(jí)的蛋白,能變出條帶嗎?辦不到??老板,我多給點(diǎn)小費(fèi),把蛋白提高到皮克級(jí),能不能變出條帶?還是辦不到??那也太差勁了,還想不想混了!不,小伙,你理解錯(cuò)了,是通通不是問題??!跟著我往下看!點(diǎn)亮您的印跡膜,一觸即發(fā)ECL試劑,即化學(xué)發(fā)光法辣根過氧化物酶(HRP)底物,是目前Westernblotting檢測中為靈敏的試劑。目前市場上普通ECL試劑在使用過程中經(jīng)常出現(xiàn)易淬滅、高背景、不穩(wěn)定以及低豐度蛋白難以檢測等問題,影
小翊帶你輕松搞定qPCR數(shù)據(jù)分析2020/05/20
化繁為簡!小翊帶你輕松搞定qPCR數(shù)據(jù)分析熒光定量PCR(qPCR)是實(shí)驗(yàn)室常用的一種技術(shù),該技術(shù)可以應(yīng)用于基因表達(dá)分析、基因分型、病原體檢測、SNP分析等。qPCR實(shí)驗(yàn)操作簡單,原理易懂,但面對(duì)一堆凌亂的數(shù)據(jù),如何進(jìn)行結(jié)果分析成了頭疼的問題,今天小翊將帶你學(xué)會(huì)如何化繁為簡,輕松獲得可以發(fā)表SCI的數(shù)據(jù)!qPCR常用的分析方法有相對(duì)定量和定量,需根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)進(jìn)行選擇。本期我們關(guān)注的是qPCR常見的應(yīng)用—基因表達(dá)分析,一般選擇相對(duì)定量法。1.實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)假設(shè)目前需要研究光誘導(dǎo)對(duì)擬南芥AtSUC2
YEASEN高性能預(yù)制膠系列產(chǎn)品2020/05/14
YEASEN高性能預(yù)制膠系列產(chǎn)品——為您的實(shí)驗(yàn)爭分奪秒產(chǎn)品背景相對(duì)于傳統(tǒng)的手工灌膠,使用預(yù)制膠可以避免接觸大量有毒試劑,節(jié)約大量時(shí)間,有效解決手工灌膠差異大等問題。YEASEN提供的蛋白預(yù)制膠包含梯度濃度和固定濃度,多種不同濃度可滿足不同蛋白電泳需求。其采用*的凝膠制備工藝制備而成,電泳效果極jia,兼容市面上各種電泳槽(Bio-Rad、天能、Life等),具有適應(yīng)性廣、分辨率高、穩(wěn)定性高、條帶清晰均勻等優(yōu)點(diǎn)。預(yù)制膠參數(shù)YEASEN高分辨率梯度預(yù)制膠,品質(zhì)更優(yōu)!·使用方便:即開即用;·適用范圍廣
活死細(xì)菌、細(xì)胞檢測2020/05/13
活死細(xì)菌、細(xì)胞檢測-----探尋生命的奧秘背景介紹真核生物(哺乳動(dòng)物細(xì)胞)和原核生物(細(xì)菌)細(xì)胞增殖和細(xì)胞死亡間平衡對(duì)維持細(xì)胞有機(jī)的發(fā)育與生命的維持至關(guān)重要,如果出現(xiàn)失衡將導(dǎo)致各種疾病的發(fā)生?;钏罓顟B(tài)是研究生物增殖生長的常見研究目的,例如;對(duì)于真核活死細(xì)胞主要通過分析細(xì)胞質(zhì)膜完整性與細(xì)胞內(nèi)酯酶活性,經(jīng)過特定儀器觀察判斷,為研究細(xì)胞狀態(tài)提供了一種方便的方法,同時(shí)分析活細(xì)胞與死細(xì)胞,用于評(píng)估細(xì)胞的活力??梢詰?yīng)用于大多數(shù)的真核哺乳動(dòng)物細(xì)胞,但不適用于真菌和酵母。主要對(duì)于藥物研究、毒性判定、細(xì)胞生長狀態(tài)
Yeasen第三代逆轉(zhuǎn)錄酶預(yù)混液2020/05/12
新品推薦|反轉(zhuǎn)、高質(zhì)量cDNA,用Yeasen第三代逆轉(zhuǎn)錄酶預(yù)混液你的逆轉(zhuǎn)錄,交給YEASEN三代逆轉(zhuǎn)錄酶來守護(hù)!Hifair®Ⅲ1stStrandcDNASynthesisSuperMixforqPCR(gDNAdigesterplus)是基于翊圣Hifair®ⅢReverseTranscriptase而開發(fā)的即用型預(yù)混液。該產(chǎn)品可耐受高達(dá)65℃的反應(yīng)溫度,適合具有復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄;同時(shí)增強(qiáng)了與模板的親和力,非常適合少量模板以及低拷貝基因的逆轉(zhuǎn)錄。產(chǎn)品帶基因組DNA去除成分,適
揭秘各種主流二代測序儀攻略2020/05/12
揭秘各種主流二代測序儀,無瓜攻略隨著基因領(lǐng)域研究的不斷深入,自sanger測序?qū)崿F(xiàn)對(duì)堿基信息的可讀取后,更高通量的需求使得二代測序在基因組測序、臨床檢測和生物制藥等領(lǐng)域展現(xiàn)出的潛力。對(duì)于剛?cè)胄械男』锇?,面?duì)各式各樣的測試平臺(tái)好奇又迷茫,Roche454、Illumina、ThermoFisher,以及國產(chǎn)MGI平臺(tái)等,這么多測序儀,他們的特點(diǎn)是什么?背后的發(fā)展歷程是怎樣的?今天小翊借花獻(xiàn)佛,梳理了目前主流的二代測序平臺(tái),讓我們了解二代測序這十幾年的發(fā)展歷程。表1二代測序部分儀器展示備注:圖片來源
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