蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析檢測技術服務詳情介紹

在過去的幾十年中，以質(zhì)譜(MS)為基礎的蛋白質(zhì)組學已經(jīng)成為鑒定蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用分析(PPIs)的重要技術。蛋白質(zhì)通過與其它蛋白質(zhì)或化合物相互作用，形成大分子化合物，從而發(fā)揮生物學功能。對蛋白質(zhì)相互作用的研究能夠幫助我們更好的理解蛋白質(zhì)。當通過IP, CO IP或GST pull-down等蛋白質(zhì)相互作用分析手段，獲得靶標蛋白后，通過質(zhì)譜分析方法對該蛋白進行分析，鑒定及定量，能夠?qū)ο嗷プ饔玫鞍走M行表征，進一步對蛋白質(zhì)功能進行分析。親和純化結(jié)合質(zhì)譜分析（Affinity purification combined with mass spectrometry, AP-MS）則允許在特定生理條件下無偏差的對相互作用蛋白進行檢測。一種做法是利用SILAC方法分別標記實驗組和對照組細胞后進行Co-IP實驗，依靠抗原與抗體之間的專一性反應分離得到免疫復合物；再通過LC-MS/MS來定性/定量檢測免疫復合物中的蛋白；當實驗組與對照組中某個蛋白質(zhì)的含量達到統(tǒng)計學差異時，判定這個蛋白質(zhì)與研究的蛋白具有相互作用，可極大降低蛋白質(zhì)互作假陽性結(jié)果可能性。SILAC技術和Co-IP-MS技術結(jié)合可用于高通量定量分析在特定情況下蛋白的互作蛋白網(wǎng)。

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對Pull-down實驗捕獲到的細胞中相互作用較低、豐度低的靶蛋白進行質(zhì)譜鑒定： 用于高通量定量分析在特定生理條件下蛋白的互作蛋白網(wǎng)絡分析：免疫共沉淀法（CO-IP）結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

GST融合蛋白Pull-down技術結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

SILAC與免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析

質(zhì)譜鑒定相互作用蛋白的兩個常用方法是肽指紋圖譜分析法（peptide fingerprinting）和niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學分析法（shot-gun proteomics）。肽指紋圖譜分析法，通過SDS-PAGE，對蛋白樣品進行分離。聚丙烯酰胺凝膠可以是考馬斯亮藍（coomassie）和銀染條帶。但是需要樣品條帶是單一條帶，即只含有一個蛋白條帶。將切下來的蛋白條帶用酶進行消化后，通過質(zhì)譜進行分析。這些消化后得到的肽段進行質(zhì)譜分析后，通過與理論數(shù)據(jù)庫進行比對的方式，生物信息學分析拼接得到目的蛋白的信息。肽指紋圖譜法的一些局限性在于，該方法需要在切膠過程中得到單一的蛋白條帶，如果有雜帶將會影響檢測的準確性，因為雜帶中的蛋白信息可能會掩蓋真實的目的蛋白的信息。因此比較適用于較純的蛋白樣品的鑒定。而niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學分析法的強大之處在于，niǎoqiāng法可以對蛋白混合物進行分析。 niǎoqiāng法蛋白質(zhì)組學的原理是先將蛋白質(zhì)樣品消化成肽段，然后將肽段通過高效液相色譜(HPLC)法進行分離。分離后的肽段直接進入質(zhì)譜儀進行分析。質(zhì)譜分析包括了兩個過程，一級質(zhì)譜（MS1）及二級質(zhì)譜（MS2）。一級質(zhì)譜獲取高效液相色譜MS1中洗脫的肽的質(zhì)量-電荷比（m/z）和肽的強度（intensity）；二級質(zhì)譜通過對肽段氨基酸序列進行確定，MS2選擇單個肽段對其進行萃裂從而得到該肽段的光譜數(shù)據(jù)。檢索軟件根據(jù)二級質(zhì)譜信息與相應的數(shù)據(jù)庫比對，結(jié)合匹配度打分及錯配過濾，可得到肽段的確切序列，進而拼接出各蛋白的完整序列，從而實現(xiàn)對蛋白的鑒定。 百泰派克生物科技既可以為您蛋白相互作用分析實驗后的蛋白樣品進行檢測，也可以您寄來樣品，百泰派克生物科技提供一站式互作蛋白檢測，包括蛋白互作實驗，IP, CO IP, GST pull-down到蛋白樣品質(zhì)譜分析一站式完成。您只需要將您的需求和樣品寄給我們，我們會負責項目后續(xù)所有事宜，包括樣品前處理、蛋白互作實驗、質(zhì)譜分析、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)分析。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測序，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學、靶向蛋白質(zhì)組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質(zhì)組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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