激酶抑制劑如何在化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)中大顯身手
2025-08-10
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激酶抑制劑如何在化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)中大顯身手?檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹
激酶(Kinase)是細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的樞紐,它們調(diào)控著細胞增殖、分化、代謝等關(guān)鍵生物過程。由于激酶活性的異常通常與腫瘤、代謝性疾病和免疫紊亂密切相關(guān),因此激酶抑制劑在jīngzhǔn醫(yī)療中長期扮演“靶向藥物”的主角。然而,激酶抑制劑的科研價值遠不止于此。在化學(xué)dànbáizhì組學(xué)(chemical proteomics)領(lǐng)域,它們正逐漸轉(zhuǎn)型為功能強大的“化學(xué)探針”,幫助研究人員識別藥物作用靶點、評估脫靶風險、解析信號網(wǎng)絡(luò),極大推動了藥物機制研究和靶點發(fā)現(xiàn)的進展。
一、化學(xué)dànbáizhì組學(xué):連接小分子與dànbáizhì組的橋梁
化學(xué)dànbáizhì組學(xué)是一種結(jié)合小分子化合物與質(zhì)譜技術(shù)的方法,核心目標是在接近生理條件下,系統(tǒng)性地識別小分子與dànbáizhì之間的相互作用。相比傳統(tǒng)方法,它具有更高的通量與更強的背景適應(yīng)性,特別適用于小分子藥物的靶點解析。
其基本流程包括:
設(shè)計具備結(jié)構(gòu)修飾位點的活性小分子(如激酶抑制劑)
應(yīng)用于細胞、組織或體外系統(tǒng)中,與目標蛋白結(jié)合
通過點擊化學(xué)或光交聯(lián)等手段固定復(fù)合物
利用高分辨率質(zhì)譜對結(jié)合蛋白進行識別與定量
這一方法的優(yōu)勢在于不依賴過表達或標簽蛋白,可在“原生環(huán)境”下實現(xiàn)更真實的蛋白互作譜分析。
二、激酶抑制劑為何適合用作化學(xué)dànbáizhì組學(xué)探針?
1、結(jié)構(gòu)明確,靶點聚焦
激酶抑制劑多數(shù)設(shè)計為ATP競爭性結(jié)構(gòu),能夠jīngzhǔn結(jié)合激酶活性位點,結(jié)合位點明確,易于在不影響活性前提下引入化學(xué)基團(如炔基、光敏基等)進行探針化改造。
2、既有選擇性,又存在脫靶可能
激酶家族結(jié)構(gòu)保守,這意味著即便是高選擇性的抑制劑,也可能與多個激酶甚至非激酶蛋白結(jié)合。化學(xué)dànbáizhì組學(xué)可在dànbáizhì組尺度上解析這些結(jié)合事件,從而提供一個完整的“靶向譜”,揭示潛在機制與副作用來源。
3、可用于活細胞或組織中,兼顧功能與表型
許多激酶抑制劑具備良好的細胞通透性,使其可以在復(fù)雜背景下開展實時結(jié)合分析,進一步拓展至功能驗證、動態(tài)響應(yīng)分析等深層次研究。
三、應(yīng)用場景:激酶抑制劑在化學(xué)dànbáizhì組學(xué)中的三大價值
1、靶點識別(Target Identification)
在新藥開發(fā)或功能研究中,研究人員經(jīng)常從表型出發(fā)篩選出具有生物活性的小分子。然而“它是如何起作用的?”常是接下來的科學(xué)問題。利用激酶抑制劑作為探針結(jié)合化學(xué)dànbáizhì組學(xué)技術(shù),可以在全蛋白層面識別其作用蛋白,明確分子靶點,推動機制闡明。
2、脫靶分析(Off-target Profiling)
激酶類藥物的副作用很大程度源于其脫靶效應(yīng)。通過構(gòu)建競爭實驗(加入游離小分子競爭結(jié)合),可識別出非特異性結(jié)合蛋白,從而篩選出更具選擇性的候選分子,提升后續(xù)開發(fā)效率與安全性。
3、激酶活性狀態(tài)分析(Kinome Profiling)
在特定設(shè)計下,某些激酶抑制劑可被用于監(jiān)測激酶家族的活性狀態(tài),繪制出“激酶活性圖譜”。這在研究藥物干預(yù)效應(yīng)、疾病狀態(tài)激酶重編程、甚至患者個體化響應(yīng)評估中都有廣泛應(yīng)用前景。
案例一覽:不止是“捕捉靶點”,更是機制研究的起點
已有多個研究團隊在不同類型的激酶抑制劑上應(yīng)用化學(xué)dànbáizhì組學(xué)策略,成功識別靶點與脫靶蛋白、構(gòu)建信號通路圖譜、發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)的潛在機制。這些案例展示了激酶抑制劑作為工具分子的廣泛適應(yīng)性,也印證了化學(xué)dànbáizhì組學(xué)在科研與轉(zhuǎn)化中的dútè價值。值得注意的是,這一策略也可與磷酸化組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白互作組學(xué)等多組學(xué)手段結(jié)合使用,為系統(tǒng)生物學(xué)研究打開全新維度。
激酶抑制劑正從“藥物分子”轉(zhuǎn)變?yōu)椤肮δ芴结槨?,在化學(xué)dànbáizhì組學(xué)中展現(xiàn)出非凡潛力。無論是靶點篩選、脫靶評估,還是信號通路研究,化學(xué)dànbáizhì組學(xué)已成為連接藥物化學(xué)與系統(tǒng)生物學(xué)的橋梁。百泰派克生物科技化學(xué)dànbáizhì組學(xué)全面解決方案包括從實驗設(shè)計、樣品制備、探針合成、靶標鑒定以及數(shù)據(jù)分析的全流程,如需定制化dànbáizhì組學(xué)技術(shù)支持,歡迎聯(lián)系我們!
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學(xué)
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準確。
三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
激酶抑制劑如何在化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)中大顯身手?檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹
北京百泰派克生物科技有限公司
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