Direct DIA：無需譜圖庫(kù)的高效蛋白質(zhì)組分析流程檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在dànbáizhì組學(xué)研究中，數(shù)據(jù)非依賴性采集（Data-Independent Acquisition, DIA）因其高通量、重現(xiàn)性強(qiáng)、數(shù)據(jù)完整性好等優(yōu)勢(shì)，正在迅速取代數(shù)據(jù)依賴性方法，成為主流技術(shù)之一。尤其是近年來興起的Direct DIA（Library-Free DIA）模式，更是在不依賴譜圖庫(kù)的前提下，實(shí)現(xiàn)了dànbáizhì組的高精度鑒定與定量，極大地降低了技術(shù)門檻并提升了數(shù)據(jù)處理效率。

一、什么是Direct DIA？

Direct DIA，即無需構(gòu)建外部DDA譜圖庫(kù)的DIA數(shù)據(jù)分析方式。它跳過了DIA流程中先行進(jìn)行數(shù)據(jù)依賴性采集（DDA）建庫(kù)的步驟，而是直接將DIA原始數(shù)據(jù)與參考蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，實(shí)現(xiàn)肽段識(shí)別與定量。這一過程主要依賴優(yōu)良的譜圖預(yù)測(cè)算法、深度學(xué)習(xí)模型以及FDR控制技術(shù)，已逐步發(fā)展為一套成熟、標(biāo)準(zhǔn)化的dànbáizhì組學(xué)分析流程。DIA通常包括“先DDA建庫(kù)、后DIA分析”兩個(gè)階段，流程復(fù)雜、成本較高且譜圖庫(kù)覆蓋范圍受限。而Direct DIA則通過算法模型自動(dòng)預(yù)測(cè)肽段碎裂譜圖，或從原始數(shù)據(jù)中構(gòu)建內(nèi)生譜圖庫(kù)，省去了建庫(kù)步驟，從而顯著簡(jiǎn)化了整體實(shí)驗(yàn)流程。

二、Direct DIA的技術(shù)支撐基礎(chǔ)

Direct DIA的實(shí)現(xiàn)依賴于三個(gè)關(guān)鍵技術(shù)環(huán)節(jié)：

1、深度學(xué)習(xí)預(yù)測(cè)譜圖

近年發(fā)展出的譜圖預(yù)測(cè)工具，如Prosit、DIA-NN和FragPipe等，已能夠根據(jù)肽段序列jīngzhǔn預(yù)測(cè)其在質(zhì)譜中的碎裂模式。這些工具通?；谏疃壬窠?jīng)網(wǎng)絡(luò)，能夠輸出高質(zhì)量的擬譜圖，用于替代傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)獲得的真實(shí)譜圖，實(shí)現(xiàn)高精度匹配和定量。

2、嚴(yán)格的FDR控制與統(tǒng)計(jì)學(xué)建模

Direct DIA分析流程內(nèi)置多層FDR控制策略，包括偽靶數(shù)據(jù)庫(kù)（decoy database）設(shè)計(jì)和多重假設(shè)檢驗(yàn)機(jī)制，以確保在無需外部譜圖庫(kù)的情況下仍能保持肽段和蛋白鑒定的高可信度，常規(guī)分析中FDR可嚴(yán)格控制在1%以內(nèi)。

3、高性能并行計(jì)算支持

由于Direct DIA需要處理大規(guī)模DIA碎片數(shù)據(jù)和復(fù)雜模型計(jì)算，通常依賴GPU并行計(jì)算或高性能計(jì)算集群，顯著提高數(shù)據(jù)分析效率。這一特性使其特別適用于大樣本量、多條件對(duì)比或臨床隊(duì)列研究。

三、Direct DIA的核心優(yōu)勢(shì)

1、降低實(shí)驗(yàn)前期負(fù)擔(dān)

DIA需優(yōu)良行多次DDA實(shí)驗(yàn)用于建庫(kù)，既耗時(shí)又增加樣本消耗。Direct DIA免除建庫(kù)流程，只需采集DIA數(shù)據(jù)，即可開展后續(xù)分析，顯著壓縮了實(shí)驗(yàn)周期與資源投入。

2、提升分析一致性與重現(xiàn)性

由于Direct DIA不依賴特定實(shí)驗(yàn)條件下構(gòu)建的譜圖庫(kù)，其分析過程標(biāo)準(zhǔn)化程度更高，有效避免了批次間差異和建庫(kù)偏差，提升了數(shù)據(jù)的可比性和重復(fù)性，尤其適合多中心合作研究。

3、保持較高的靈敏度與覆蓋度

隨著譜圖預(yù)測(cè)技術(shù)不斷進(jìn)步，Direct DIA已能在不犧牲鑒定深度的前提下，實(shí)現(xiàn)與建庫(kù)DIA相當(dāng)甚至更優(yōu)的性能，尤其在檢測(cè)低豐度蛋白、變異肽或修飾肽方面表現(xiàn)出色。

4、更適用于復(fù)雜或非標(biāo)準(zhǔn)樣本

對(duì)于臨床體液、FFPE組織、環(huán)境樣本等難以穩(wěn)定建立高質(zhì)量譜圖庫(kù)的樣本類型，Direct DIA提供了更靈活的解決方案，具備更強(qiáng)的適應(yīng)性和推廣性。

5、成本控制更優(yōu)，易于標(biāo)準(zhǔn)化推廣

通過簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程、減少建庫(kù)成本與數(shù)據(jù)處理復(fù)雜性，Direct DIA為廣大科研實(shí)驗(yàn)室提供了高性價(jià)比的解決方案，也為蛋白組學(xué)在臨床轉(zhuǎn)化中的大規(guī)模應(yīng)用鋪平了道路。

四、Direct DIA的應(yīng)用潛力

Direct DIA在多個(gè)研究方向中展現(xiàn)出jíqiáng的適應(yīng)性與拓展性：

• 腫瘤和代謝疾病研究：適合分析復(fù)雜臨床樣本，助力發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)蛋白與潛在生物標(biāo)志物；

• 藥物作用機(jī)制探索：可用于高通量藥物處理組的蛋白譜監(jiān)測(cè)，揭示調(diào)控路徑變化；

• 長(zhǎng)期隊(duì)列研究：分析流程標(biāo)準(zhǔn)、數(shù)據(jù)重現(xiàn)性高，適合多時(shí)間點(diǎn)或多中心樣本比較；

• 多組學(xué)聯(lián)合分析：Direct DIA輸出數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化程度高，便于與轉(zhuǎn)錄組、代謝組等數(shù)據(jù)整合，進(jìn)行系統(tǒng)生物學(xué)建模。

Direct DIA不僅極大簡(jiǎn)化了實(shí)驗(yàn)流程，還提升了分析效率和數(shù)據(jù)質(zhì)量，為科研人員在復(fù)雜樣本、大規(guī)模隊(duì)列和臨床轉(zhuǎn)化研究中提供了更具可行性的技術(shù)路徑。百泰派克生物科技整合了優(yōu)良的質(zhì)譜儀器平臺(tái)與深度優(yōu)化的數(shù)據(jù)分析流程，提供全流程的DIA定量dànbáizhì組學(xué)服務(wù)，覆蓋從樣本處理、質(zhì)譜采集到數(shù)據(jù)解讀的每一個(gè)環(huán)節(jié)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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