什么是靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

“靶向定量dànbáizhì組學(xué)”（Targeted Quantitative Proteomics）是一種高靈敏度、高特異性的dànbáizhì組分析策略，廣泛應(yīng)用于生物標(biāo)志物驗(yàn)證、疾病機(jī)制研究、藥效學(xué)評(píng)估和質(zhì)量控制等領(lǐng)域。相比發(fā)現(xiàn)型（Discovery）dànbáizhì組學(xué)，靶向定量強(qiáng)調(diào)對(duì)特定目標(biāo)蛋白進(jìn)行jīngzhǔn、重復(fù)性強(qiáng)的定量分析。

本文將從基本原理、主流技術(shù)平臺(tái)、實(shí)驗(yàn)流程到典型應(yīng)用，系統(tǒng)梳理靶向定量dànbáizhì組學(xué)的核心內(nèi)容，幫助研究人員科學(xué)選擇合適的技術(shù)方案。

一、什么是靶向定量dànbáizhì組學(xué)？

靶向定量dànbáizhì組學(xué)以預(yù)選的蛋白或肽段為對(duì)象，通過(guò)設(shè)定特定的離子轉(zhuǎn)移通道或全產(chǎn)物離子掃描策略，獲取目標(biāo)的定量信息。其特點(diǎn)包括：

1、明確靶點(diǎn)（目標(biāo)蛋白或肽段）

2、使用標(biāo)準(zhǔn)品或內(nèi)標(biāo)進(jìn)行定量校正

3、重復(fù)性強(qiáng)，適合臨床與大樣本研究

4、檢測(cè)靈敏度遠(yuǎn)高于發(fā)現(xiàn)型蛋白組

二、主流技術(shù)平臺(tái)

1、MRM/SRM（Multiple/Selected Reaction Monitoring）

（1）儀器平臺(tái)：三重四極桿質(zhì)譜（Triple Quadrupole）

（2）原理：選擇特定前體離子 → 誘導(dǎo)斷裂 → 檢測(cè)特定產(chǎn)物離子

（3）特點(diǎn)：

* 高通量、低背景干擾

• 適合數(shù)十~數(shù)百個(gè)靶點(diǎn)的定量

• 與代謝組學(xué)中MRM思路一致

2、PRM（Parallel Reaction Monitoring）

（1）儀器平臺(tái)：高分辨率質(zhì)譜（如Orbitrap、Q-TOF）；

（2）原理：選擇前體離子 → 同時(shí)記錄所有產(chǎn)物離子

（3）特點(diǎn)：

* jīngzhǔn度更高，特異性更強(qiáng)

• 適合復(fù)雜背景中的靶點(diǎn)識(shí)別

• 可應(yīng)用于驗(yàn)證階段或臨床樣本

3、DIA-based靶向方法

（1）趨勢(shì)：整合高分辨DIA（Data-independent acquisition）技術(shù)，通過(guò)內(nèi)標(biāo)引導(dǎo)實(shí)現(xiàn)高效靶向分析

（2）優(yōu)勢(shì)：

* 提高多肽覆蓋度

• 適合多樣本高通量定量

三、靶向定量dànbáizhì組與發(fā)現(xiàn)型蛋白組的對(duì)比

四、靶向定量dànbáizhì組學(xué)實(shí)驗(yàn)流程概覽

1、靶點(diǎn)篩選與肽段設(shè)計(jì)

* 來(lái)源于前期DIA分析、文獻(xiàn)報(bào)道、數(shù)據(jù)庫(kù)（如PeptideAtlas）

• 篩選穩(wěn)定、特異、離子化效率好的肽段作為定量單位

2、標(biāo)準(zhǔn)品合成（可選）

合成穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽（SIS）用于juéduì定量

3、樣本前處理

蛋白提取 → 酶解 → 凈化 → 加入內(nèi)標(biāo)

4、質(zhì)譜分析

根據(jù)項(xiàng)目選擇MRM或PRM

5、數(shù)據(jù)處理與定量分析

Skyline、SkyQuant、Scaffold DIA等zhuānyè軟件

五、靶向定量dànbáizhì組學(xué)的應(yīng)用場(chǎng)景

1、生物標(biāo)志物驗(yàn)證

在腫瘤、自身免疫病、感染性疾病等研究中，MRM/PRM常用于驗(yàn)證前期篩選出的候選蛋白，支持轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究。

2、藥效學(xué)與毒理學(xué)評(píng)估

監(jiān)測(cè)藥物干預(yù)前后特定蛋白的表達(dá)變化，評(píng)價(jià)藥物靶點(diǎn)、作用通路是否被調(diào)控。

3、合成生物學(xué)與蛋白表達(dá)優(yōu)化

在細(xì)胞工廠(chǎng)構(gòu)建過(guò)程中，對(duì)關(guān)鍵酶蛋白的表達(dá)水平進(jìn)行定量，優(yōu)化表達(dá)效率。

4、質(zhì)量控制與批間一致性檢測(cè)

在生物制品生產(chǎn)（如抗體、重組蛋白）中監(jiān)測(cè)特定雜質(zhì)蛋白或功能位點(diǎn)表達(dá)。

在靶向定量dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域，百泰派克生物科技整合高靈敏三重四極桿質(zhì)譜平臺(tái)與高分辨Orbitrap平臺(tái)，可提供包括MRM、PRM、內(nèi)標(biāo)定量在內(nèi)的多種服務(wù)形式：

* 個(gè)性化靶點(diǎn)設(shè)計(jì)服務(wù)：支持文獻(xiàn)挖掘、DIA數(shù)據(jù)整合、靶點(diǎn)篩選

• 高質(zhì)量穩(wěn)定同位素標(biāo)記肽定制

• 標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)處理流程，保證結(jié)果一致性與可比性

• 支持從發(fā)現(xiàn)型蛋白組到靶向驗(yàn)證的全流程服務(wù)

靶向定量dànbáizhì組學(xué)是從“廣撒網(wǎng)”到“jīngzhǔn打擊”的關(guān)鍵一步，它在疾病機(jī)制研究、臨床轉(zhuǎn)化和生物制藥中的價(jià)值不斷提升。通過(guò)選擇合適的技術(shù)平臺(tái)（MRM或PRM）和優(yōu)化實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，科研人員可以實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)蛋白的靈敏、穩(wěn)定和可重復(fù)檢測(cè)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線(xiàn)性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專(zhuān)有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶(hù)提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶(hù)提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿(mǎn)足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶(hù)的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

什么是靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)？檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹