SWATH-MS無標記蛋白質(zhì)定量技術解析檢測技術服務詳情介紹

在后基因組時代，系統(tǒng)性地識別和定量dànbáizhì成為理解生物過程和疾病機制的關鍵步驟。dànbáizhì組學發(fā)展迅速，從二維凝膠電泳到高分辨率質(zhì)譜技術的興起，定量策略也逐漸演化為更jīngzhǔn、可重復性更高的形式。其中，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）作為一種無標記定量方法，正成為dànbáizhì組定量分析的重要工具。

一、SWATH-MS技術概述

SWATH-MS是基于數(shù)據(jù)獨立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）的質(zhì)譜方法，它將質(zhì)譜分析過程劃分為一系列特定的m/z窗口，對每個窗口內(nèi)的所有離子進行并行碎裂。在SWATH-MS中，質(zhì)譜儀按照預設m/z區(qū)間順序掃描樣本中所有的前體離子，每個窗口內(nèi)的所有離子幾乎同時被碎裂并記錄。這一策略大大提高了數(shù)據(jù)采集的全面性與重現(xiàn)性，使得對復雜生物樣本中dànbáizhì的全面無偏識別與定量成為可能。

二、SWATH-MS的工作原理詳解

SWATH-MS的核心流程可分為以下幾個關鍵步驟：

1、m/z窗口的劃分與采集

儀器將整個m/z范圍劃分為若干個固定寬度的窗口（例如25 m/z寬度），在質(zhì)譜采集過程中，每個窗口中的所有離子被碎裂。與DDA相比，SWATH不依賴實時離子選擇，而是系統(tǒng)性地對所有窗口進行采集，因此被稱為無偏全掃描模式。

2、全掃描MS/MS數(shù)據(jù)的獲取

每個m/z窗口的所有前體離子碎裂產(chǎn)生大量MS/MS譜圖，記錄了特定時間段內(nèi)的碎片離子信息。由于信息密度高且復雜，原始數(shù)據(jù)需要借助已有的光譜庫進行解析。

3、參考光譜庫進行識別與定量

SWATH-MS的dànbáizhì識別依賴于事先構(gòu)建的光譜庫（通常來自DDA數(shù)據(jù)），通過匹配保留時間、碎片離子m/z和強度等特征，實現(xiàn)目標肽段的識別與定量。這一過程需要借助zhuānyè軟件，如OpenSWATH、Spectronaut、DIA-NN等。

三、SWATH-MS的優(yōu)勢分析

1、無需標記，降低實驗成本與復雜性

SWATH-MS不依賴于iTRAQ、TMT等同位素標記策略，避免了標記效率偏差與樣本通量限制。尤其適用于臨床樣本、動物組織等不易進行標記的材料。

2、高重現(xiàn)性，適合大規(guī)模隊列研究

由于其基于固定掃描窗口的全覆蓋式采集，SWATH-MS在重復性方面表現(xiàn)優(yōu)異。其跨批次、一致性強的數(shù)據(jù)特性，非常適合應用于疾病隊列研究、生物標志物篩選等需要高穩(wěn)定性的場景。

3、定量動態(tài)范圍廣，識別低豐度蛋白

SWATH-MS通過對所有前體離子的全面掃描，顯著提升了低豐度蛋白的檢出率。結(jié)合高分辨質(zhì)譜儀器，可以實現(xiàn)較廣泛的動態(tài)范圍覆蓋，有助于深入解析信號通路中關鍵但不易被檢測的蛋白因子。

4、可重分析性強，利于數(shù)據(jù)挖掘

SWATH-MS數(shù)據(jù)保留了所有碎片離子的原始信息，后期可基于新的光譜庫重復進行數(shù)據(jù)解析。這種“可重用性”在生物信息分析與數(shù)據(jù)庫建設中具有重要意義。

四、SWATH-MS在科研與轉(zhuǎn)化醫(yī)學中的應用

SWATH-MS的應用場景正在迅速擴展，涵蓋從基礎研究到臨床轉(zhuǎn)化的多個領域。

1、生物標志物發(fā)現(xiàn)

在腫瘤、神經(jīng)退行性疾病、代謝疾病等研究中，SWATH-MS憑借其高通量和定量準確性，廣泛用于尋找疾病特異性蛋白表達模式。例如，在癌癥dànbáizhì組研究中，SWATH-MS成功鑒定出多個與復發(fā)風險相關的差異蛋白。

2、藥物作用機制研究

SWATH-MS可用于比較藥物處理前后樣本的dànbáizhì表達譜，幫助揭示藥物作用靶點及信號通路變化。其高重現(xiàn)性的特點特別適合劑量梯度與時間梯度實驗設計。

3、跨物種蛋白表達比較

在模式生物（如小鼠、斑馬魚）與人類組織的dànbáizhì表達譜對比中，SWATH-MS提供了穩(wěn)定而全面的數(shù)據(jù)支持，為功能保守性研究提供重要線索。

4、多組學集成分析

SWATH-MS可與轉(zhuǎn)錄組、代謝組數(shù)據(jù)協(xié)同分析，構(gòu)建多層次調(diào)控網(wǎng)絡。例如在免疫研究中，通過整合dànbáizhì組與轉(zhuǎn)錄組信息，可以發(fā)現(xiàn)炎癥反應中蛋白翻譯后修飾的關鍵節(jié)點。

SWATH-MS作為無標記、數(shù)據(jù)獨立采集的dànbáizhì定量技術，已逐步發(fā)展為dànbáizhì組學研究的中堅力量。在科研需求日益精細化的當下，SWATH-MS不僅是技術選擇，更是驅(qū)動科學發(fā)現(xiàn)與臨床轉(zhuǎn)化的引擎。歡迎關注百泰派克生物科技。我們致力于提供高質(zhì)量、高覆蓋率的SWATH定量蛋白組學服務，為您的科學研究注入新動力。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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