常用CD光譜分析工具怎么選？BeStSel與DichroWeb對(duì)比解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在結(jié)構(gòu)生物學(xué)和dànbáizhì研究中，圓二色性（Circular Dichroism, CD）光譜是一種重要的工具，廣泛應(yīng)用于dànbáizhì二級(jí)結(jié)構(gòu)分析、構(gòu)象變化監(jiān)測(cè)以及熱穩(wěn)定性評(píng)估。CD光譜提供了對(duì)dànbáizhì折疊狀態(tài)的快速、非破壞性檢測(cè)手段，但其數(shù)據(jù)解讀高度依賴于計(jì)算工具和算法的支持。當(dāng)前主流的CD數(shù)據(jù)分析平臺(tái)包括BeStSel和DichroWeb，兩者均被廣泛采用，卻在算法原理、分析精度和適用場(chǎng)景上各有千秋。本文將圍繞“CD光譜分析工具怎么選”這一核心問題，從功能、算法精度、適配性等維度對(duì)BeStSel與DichroWeb進(jìn)行深入解析，為結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究人員提供實(shí)用參考。

一、什么是CD光譜分析？為什么離不開計(jì)算工具？

CD光譜是由手性分子對(duì)圓偏振光吸收差異產(chǎn)生的譜圖，dànbáizhì的不同二級(jí)結(jié)構(gòu)（α-螺旋、β-折疊、無(wú)規(guī)卷曲）在190–260 nm波長(zhǎng)區(qū)間具有特征信號(hào)。由于CD信號(hào)強(qiáng)度弱且各結(jié)構(gòu)的譜圖高度重疊，單靠肉眼難以jīngquè判斷蛋白結(jié)構(gòu)組成比例，這便凸顯了計(jì)算工具的重要性。

※ 理想的CD分析工具應(yīng)具備以下特征：

• 高準(zhǔn)確性：可區(qū)分相似的結(jié)構(gòu)特征，如平行與反平行β折疊；

• 高通量兼容性：支持批量分析與自動(dòng)化處理；

• 數(shù)據(jù)庫(kù)依賴度低：避免因參考數(shù)據(jù)庫(kù)偏差導(dǎo)致的誤判；

• 用戶友好性強(qiáng)：便于非結(jié)構(gòu)生物學(xué)背景的研究者操作。

二、BeStSel：結(jié)構(gòu)解析的“β折疊專家”

※ 核心優(yōu)勢(shì)

BeStSel（Beta Structure Selection）專為高分辨β結(jié)構(gòu)判定而設(shè)計(jì)，特別適用于富含β-結(jié)構(gòu)的dànbáizhì。其算法不僅識(shí)別總β含量，還能進(jìn)一步細(xì)分為平行與反平行構(gòu)型，解決了傳統(tǒng)算法難以區(qū)分β類型的難題。

• dútè算法：基于廣泛的實(shí)驗(yàn)參考光譜庫(kù)，結(jié)合支持向量機(jī)（SVM）回歸優(yōu)化，提升分類準(zhǔn)確率。

• 結(jié)構(gòu)敏感性強(qiáng)：尤其在β-結(jié)構(gòu)占比高的蛋白中表現(xiàn)出色。

• 支持跨物種數(shù)據(jù)：算法不依賴單一數(shù)據(jù)庫(kù)，適配多種生物樣本。

※ 潛在局限

BeStSel對(duì)α-螺旋富集蛋白的適配性相對(duì)較弱，若研究對(duì)象為膜蛋白或天然無(wú)序蛋白，建議搭配其他工具輔助分析。

三、DichroWeb：通用型CD數(shù)據(jù)處理平臺(tái)

※ 核心優(yōu)勢(shì)

DichroWeb是一個(gè)成熟的CD光譜分析平臺(tái)，提供多種算法選擇（如CONTIN、CDSSTR、SELCON3等），適合大多數(shù)水溶性蛋白的結(jié)構(gòu)評(píng)估。其優(yōu)勢(shì)在于算法靈活性高、參考數(shù)據(jù)庫(kù)豐富，尤其適合進(jìn)行批量數(shù)據(jù)比對(duì)和交叉驗(yàn)證。

• 多算法支持：可根據(jù)樣本特性選擇zuì適合的擬合模型。

• 操作界面友好：支持在線數(shù)據(jù)提交和圖形化輸出結(jié)果。

• 數(shù)據(jù)庫(kù)quánwēi：集成多個(gè)經(jīng)驗(yàn)證的數(shù)據(jù)集，提高預(yù)測(cè)穩(wěn)定性。

※ 潛在局限

DichroWeb對(duì)jíduān結(jié)構(gòu)或人工dànbáizhì的分析準(zhǔn)確性有所下降，且較依賴參考數(shù)據(jù)庫(kù)的代表性。

四、BeStSel vs.DichroWeb：怎么選？

CD光譜作為蛋白結(jié)構(gòu)研究中的常規(guī)技術(shù)，其分析質(zhì)量高度依賴工具算法的選擇與使用策略。BeStSel和DichroWeb各具優(yōu)勢(shì)，并非互斥，而是應(yīng)被視為互補(bǔ)的分析組件。在未來(lái)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究中，合理整合多工具的能力將直接決定數(shù)據(jù)解釋的深度與準(zhǔn)確性。百泰派克生物科技構(gòu)建了完善的CD數(shù)據(jù)分析與結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)服務(wù)體系，結(jié)合自主優(yōu)化的數(shù)據(jù)處理流程與多平臺(tái)工具互補(bǔ)機(jī)制，確?？蛻臬@得更加jīngquè且可重復(fù)的蛋白結(jié)構(gòu)信息。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)先進(jìn)，填補(bǔ)技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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