無標記定量肽組學：探索樣本中肽的真實表達量檢測技術服務詳情介紹

“無biāojìdìng量肽組學”（Label-Free Quantitative Peptidomics, LFQ）是一種利用質譜技術進行dànbáizhì/肽段定量的方法，通過該方法能有效探索樣本中肽的真實表達量，具有無需引入同位素或化學標簽的優(yōu)勢，適用于高通量、低成本、多樣本的生物學研究，它通過測量肽段在質譜中的信號強度或譜圖數(shù)量，間接推算其在樣本中的相對豐度的定量方法。不同于 SILAC、TMT 等標簽技術，LFQ 不依賴任何外源標記，適用于更廣泛的樣本類型和研究場景。標簽方法（如 SILAC、TMT、iTRAQ）雖廣受歡迎，但成本高、實驗流程復雜。相比之下，“無biāojìdìng量肽組學”以其無需化學標簽、成本更低、操作更靈活的優(yōu)勢，越來越多地被科研團隊和生物醫(yī)藥企業(yè)采用。

一、無biāojìdìng量肽組學的主流定量方法

1、基于離子強度（Intensity?Based LFQ）

利用 MS1 峰面積（Area Under the Curve, AUC）或峰強度與肽濃度呈線性相關性進行定量。依托高分辨質譜（如 Orbitrap、FT?ICR），可覆蓋 2?3 個數(shù)量級的動態(tài)范圍，非常適合檢測低豐度蛋白。

2、基于譜圖計數(shù)（Spectral?Counting）

統(tǒng)計 MS2 的觸發(fā)次數(shù)，認為捕獲次數(shù)與蛋白豐度成正比。方法直觀易實現(xiàn)，但對低豐度肽靈敏度相對較低，線性范圍較窄。

近年來，“數(shù)據獨立采集（DIA）”技術融合強度和譜圖數(shù)據優(yōu)勢，實現(xiàn)高覆蓋、低漏檢的無biāojìdìng量，成為行業(yè)趨勢。

二、無biāojìdìng量肽組學技術流程詳解

1、樣本制備

從組織、細胞或生物液體（血清、尿液等）中提取dànbáizhì，經yídànbáiméi酶解生成肽段。LFQ 跳過化學標簽步驟，流程更簡潔，通用性更強。

2、LC?MS/MS 分析

（1）使用高性能液相色譜分離肽段

（2）采用 DDA 或 DIA 模式采集 MS 數(shù)據

（3）DIA 模式下，采集覆蓋所有 m/z 區(qū)間，可極大提高定量覆蓋度和重現(xiàn)性

3、定量處理

（1）結合zhuānyè軟件（如 MaxQuant、OpenMS、Proteome Discoverer），完成峰提取、保留時間對齊與強度標準化

（2）通過對照樣本、內標或歸一化方法修正技術誤差

4、差異統(tǒng)計分析

（1）實施 t?檢驗、ANOVA、多重假設校正

（2）構建 Volcano 圖、熱圖等可視化結果，引導下游生物學解讀

5、生物驗證階段

核心肽段或差異蛋白進一步使用 PRM（Parallel Reaction Monitoring）、WB（Western Blot）、ELISA 等手段驗證，增強結果可信度。

三、無biāojìdìng量肽組學優(yōu)勢一覽

1、高通量、jíjù靈活性：無需標簽合成，批次少，適合進行大樣本、高重復實驗。

2、顯著成本優(yōu)勢：省去昂貴的同位素試劑，實驗成本下降約?30–50%，適合科研或企業(yè)預算受限情況。

3、動態(tài)范圍寬3 個數(shù)量級：zhuóyuè的檢測潛力適合探索復雜樣本中的低豐度肽。

4、實驗隨需增樣：自由擴充樣本量，頻繁用于探索性研究、臨床隊列、藥效篩檢等場景。

5、兼容多種樣本類型：適用于 FFPE、血清、組織、細胞系等多種生物樣本，無“標簽兼容”困擾。

四、挑戰(zhàn)與局限

1、批次重現(xiàn)性問題：各批次實驗獨立，儀器漂移增加變異，需通過內標或批次校正策略控制噪聲。

2、低豐度肽敏感性不足：在復雜背景中弱信號可能難以被 MS 探測，需優(yōu)化 LC 梯度與質譜參數(shù)。

3、數(shù)據處理繁重：高通量產出 PB 級數(shù)據，缺失值*、對齊和濾除冗余流程復雜。

4、定量精度略遜于標簽法：與 SILAC、TMT 等方法相比，無標記 LFQ 有時精度略低，但工具和算法正在縮小這一差距。

五、應用場景：科研實踐與產業(yè)落地

1、生物標志物發(fā)現(xiàn)

通過 LFQ 對比疾病 vs 健康樣本，篩選潛在生物標志物（oncoproteins、炎癥指標等），再結合 PRM 驗證以提高可信度。

2、藥物作用機制研究

藥物處理后細胞或動物模型中定量對比蛋白表達變化，解析信號通路和機制預測。

3、質量控制與批次一致性監(jiān)測

制藥領域用于疫苗、重組蛋白生產中宿主蛋白（HCP）監(jiān)控，保障生物制品安全性和穩(wěn)定性。

4、環(huán)境與代謝應答研究

用于植物、微生物、動物模型在外界應激、藥物、化合物干預后的蛋白組響應監(jiān)測，助力代謝機制解析。

六、新興趨勢與前沿突破

1、nDIA（窄帶寬 DIA）技術：兼顧覆蓋深度與采樣速度，可實現(xiàn) 15–30 分鐘 LC 梯度高通量分析。

2、DirectLFQ 等高階歸一化算法：通過自動化歸一化、大規(guī)模批次標準校正，提高信號精度。

3、單細胞蛋白組 LFQ：借助 nano-LC 與高靈敏 MS，逐步拓展至單細胞層面的表達測序。

4、標準化社區(qū)推動：如 HUPO-PSI 標準格式（mzML、mzTab）促進數(shù)據互通與公開共享。

作為 LFQ 領域先鋒，百泰派克生物科技 致力于提供一站式高質量無biāojìdìng量肽組學解決方案，隨著 DIA、DirectLFQ 以及社區(qū)標準化進展，LFQ 的精度與重現(xiàn)性將持續(xù)提升。百泰派克生物科技擁有人才、設備和經驗優(yōu)勢，能為科研團隊和產業(yè)用戶提供高質量、可信賴、可量化的肽組定量服務，攜手邁向定量組學新時代。如果您正從事生物標志物開發(fā)、藥物機制研究或疫苗/生物制品質量監(jiān)控，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技，獲取zhuānyè LFQ 定量肽組學支持——zhuānyè分析，科技驅動，加速科研突破。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數(shù)據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

無標記定量肽組學：探索樣本中肽的真實表達量檢測技術服務詳情介紹